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生物奥赛分子生物学-2013

* * * * * * * 核糖体 有很多双螺旋区 三、核糖体的功能位点 蛋白质合成过程 原核生物转录与翻译共线性 植物细胞生物具有三种不同蛋白和成体系:线粒体、叶绿体、细胞质, 它们在核糖体成分、tRNA等具有不同。 75%; ~20000 proteins 20%; 50~100 proteins 2~5%; proteins variable 翻译后加工 -----从单一蛋白质扩大功能的方式( 不同折叠、修饰、亚基组装----多种功能) 翻译后的加工 移去部分氨基酸(信号肽、C或N) 折叠(共折叠和翻译后折叠) 降解(泛素介导的蛋白酶体降解) 修饰(磷酸化,糖基化,甲基化,乙酰化等) Systemin(系统素), a peptide hormone, is formed by plant cells in response to wounding. precursor 前体 系统素(18肽) Molten globule (溶球) 共翻译折叠 分子伴侣防止错误折叠 Hsp70 (70KD) Hsp70结合新合成的肽链,维持可溶状态,然后送至折叠复合体中进一步折叠 Protein降解的生理意义 除去不正常(失去功能的、错误折叠、错误加工)的蛋白; 回收降解蛋白的氨基酸, 实现氨基酸的在循环利用。 维持聚合蛋白亚基的比例,防止亚基过量积累; 泛素分子结构 泛素 (Ubiquitin) 76aa E1: ubiquitin- activating enzyme E2: ubiquitin-conjugating enzyme E3: ubiquitin-ligating enzyme 蛋白酶体 蛋白酶体结构 生物组学 -----分析细胞基因组DNA序列及其表达的所有mRNA和蛋白质种类及其相对数量的一门学科。它基于高通量(一次实验分析大量数据)的基因芯技术和2-D-MS技术(双向电泳偶联质谱),并借助生物信息学分析手段获得细胞整体基因表达模式。 基因组学:单倍体细胞中所有DNA序列,可以揭示基因数量、分布、物种进化、分子标记等重要信息。多采用SHOT GUN全基因组测序技术。 转录组学:细胞中所有mRNA种类及其相对数量,具有特定的细胞类型、发育阶段和外界条件依赖性。多采用表达谱芯片技术。 蛋白质组学:细胞中所有蛋白质种类及其相对数量,具有特定的细胞类型、发育阶段和外界条件依赖性。多采用双向电泳技术。 蛋白质组学:细胞中所有蛋白质种类及其相对数量,具有特定的细胞类型、发育阶段和外界条件依赖性。多采用双向电泳技术。 组蛋白乙酰化和脱乙酰化影响 染色质的紧密程度从而影响转录因子与启动子结合。 胞嘧啶与组蛋白的修饰 胞嘧啶 甲基化 H3K27 甲基化 H3K4 甲基化 组蛋白H3 化学修饰 转录后加工 -----从单一基因扩大编码mRNA分子种类 一基多能 基因复制-----转录后加工(可变剪接、可变启动子、可变加尾和RNA编辑)-----多种mRNA分子----多种蛋白质 真核基因转录后加工过程不但是形成成熟mRNA的必要过程(加帽、内含子剪接和加尾),同时也是重要的调控步骤。这一步骤使得单一的前体mRNA通过可变剪接、RNA编辑和可变加尾形成多种mRNA分子。此外,在同一个基因位点可以存在多个启动子和多个加尾位点,也可以驱动多种mRNA分子合成。综合这些加工手段(可变剪接、可变加尾、可变启动子和RNA编辑),最终从单一个基因产生多种mRNA分子,是遗传性信息扩大的重要手段。 一基多能 基因复制-----转录后加工(可变剪接、可变启动子、可变加尾和RNA编辑)-----多种mRNA分子----多种蛋白质 剪接基本元件(剪接位点和分支点) 5’..A A G U A A G U…..CURAY..(10-40).(U/C)N C A G G…3’ 外显子 5’剪切位点 内含子 外显子 3’剪切位点 分支点序列 嘧啶区 内含子剪接:位于内含子和外显子中的剪接元件识别并招募剪接机器,通过两次转酯反应完成除去内含子连接外显子,并护送出细胞核参与蛋白翻译过程。 mRNA剪接位点与SnRNA之间的相互识别 U1 snRNP结合在5?端拼接点 U2 snRNP结合在分支点 需要SR蛋白正确引导 U4/U6和U5 snRNP三聚体进入拼接体, U6结合U2 剪接过程-顺序组装,动态的流水席 U1 、U4被释放 U6结合

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