T细胞受体激活过程模拟.pdfVIP

北京大学学报 ( 自然科学版), 第 48 卷 , 第 1 期 , 2012 年 1 月　 Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Pekinensis, Vol. 48, No. 1 (Jan. 2012)　 T 细胞受体激活过程模拟 † 王路 欧阳颀 北京大学物理学院 , 北京大学理论生物学中心 , 北京 100871; † E-mail: wanglu624@ 摘要 对免疫系统 T 细胞受体结合外源多肽段后诱导的一系列受体磷酸化反应过程进行了系统的理论模拟。 T 细胞受体对于不同外源分子产生敏感而特异的反应, 可以由动力学校验模型进行解释。拓展了早期的动力 学校验模型, 放宽和改进了原有模型对去磷酸化速率和以固定顺序进行受体磷酸化这两方面的假设, 得到了 更一般的反应网络模型, 从数学模拟角度很好的满足和解释了生理上 T 细胞所表现出的对外源分子识别的敏 感性、特异性和激活时间短等重要性质。 关键词 T 细胞受体; 动力学校验模型; 多位点磷酸化; 信号转导通路 ; 生化反应网络 中图分类号 Q612 Modeling the Activation of T Cell Receptors † WANG Lu , OUYANG Qi School of Physics and Center for Theoretical Biology, Peking University, Beijing 100871; † E-mail: wanglu624@ Abstract The authors use the strategy of kinetic proofreading model to simulate the process of T-cell receptor (TCR) activation and phosphorylation, and modify the original kinetic proofrading model to explain the multi-phosphorylation process of T-cell receptors as proofreading steps which can amplify the tiny difference in the peptide-TCR binding affinity. The new model expands the previous kinetic proofreading models, and removes the two important assumptions in those models. One is that the dephosphorylation rate constant β is assumed to be very large; the other is that the kinetic mechanism of multi-phosphorylation is sequential phosphorylation mechanism. Based on the more general model, besides the specificity of T cell activation, the results successfully interpret ot