底物与酶结合.PPT

第二节 酶的结构与功能 一、酶的分子组成与分类 二、酶的辅助因子 三、酶的结构与功能 酶的活性中心和必需基团 酶的活性中心与酶作用的专一性 酶的活性中心与酶原的激活 三、酶的结构与功能 酶分子上具有一定空间构象的部位，该部位化学基团集中，直接参与将底物转变为产物的反应过程，即与催化作用直接相关的部位，称为酶的活性中心(active center)。 酶催化活性有关的基团 必需基团 （二）、酶的活性中心与酶作用的专一性 例：丝氨酸蛋白水解酶族的一级结构 3、酶专一性与结合基团有关 胰蛋白酶:与胰凝乳蛋白酶相似,具有口袋, 但结合部位由一个带负电荷的Asp代替了Ser,只能与带有正电荷氨基酸残基如 Lys 、 Arg 结合。 弹性蛋白酶: 结合部位入口处是Val和Thr（侧链长）, 只能让侧链体积小Gly和Ala等进入。 酶原的激活 第三节 酶作用的机制 （二）、诱导契合学说(induced-fit hypothesis) （三）、酶作用高效率的机制 1、趋近与定向效应 邻近效应(proximity effect) 酶将诸底物结合到其活性中心，使它们的反应 基团相互靠近，降低进入过渡态所需的活化 能；底物在酶活性中心的有效浓度大大增加 定向排列(orientation arrange )： 酶活性中心的立体构型和相关基团的诱导、定向 作用，使诸底物参与反应的基团形成正确的几 何定向关系，相互接近，产生有效碰撞。 2、“张力”和“形变” 3、多元催化(multielement catalysis) 包括：酸-碱催化， 共价催化（亲核、亲电催化）， 或多种催化形式的协同作用等。 同种基团在不同的微环境下解离度亦不同，这种多功能基团兼有酸、碱双重催化效能。 共价催化（又称亲核催化或亲电催化） 酶分子中可作为亲核基团和酸硷催化功能基团 例:胰凝乳蛋白酶催化肽键水解的多种类催化机制 酰基一酶中间体虽然 不稳定, 但 它的存在已经被X射线衍 射实验所证实。 4. 表面效应(surface effect)： 酶活性中心的疏水环境排除了水分子对酶和底物功能基团的干扰、吸引或排斥，防止酶和底物之间形成水化膜，有利于酶和底物的密切接触。——疏水的为微环境极大利于酶的催化作用 酶活性中心的低介电区(表面效应 surface effect) 化学基团的反应活性和反应速率在非极性介质 和水性介质有显著差别 第六节 重要的酶类及酶活性的调节 一、寡聚酶 由两个或两个以上，乃至多达数十个亚基组成的酶称为寡聚酶。其分子量从35000到几百万，可分为几种不同的类型： 1）含相同亚基的寡聚酶 2）含不同亚基的寡聚酶 含不同亚基的寡聚酶 1. 双功能寡聚酶 2. 含有专一性的、非酶蛋白亚基的寡聚酶 3. 具有底物载体亚基的寡聚酶 1. 双功能寡聚酶 所含的亚基结构不同，每种亚基表现不同的功能，整个酶分子可以催化两个相关的反应。 举例：大肠杆菌的色氨酸合成酶 色氨酸合成酶 含A和B两种蛋白质 蛋白质A：含有一个亚基α， 蛋白质B：含有两个亚基ββ。 色氨酸合成酶催化的化学反应 2.含有专一性、非酶蛋白亚基的寡聚酶 乳糖合成酶催化乳糖的合成反应 B蛋白：是α-乳清蛋白，一个特殊的非酶蛋白。 研究表明： 反应（2）中加入B后，该反应受到抑制, 反应（1）则加强。 3. 具有底物载体亚基的寡聚酶 由酶蛋白部分和底物载体蛋白部分组成。 例如：大肠杆菌的乙酰辅酶A羧化酶 乙酰辅酶A羧化酶三个部分联结起来催化的反应 二、变构酶与变构调节 变构酶(allosteric enzyme) 具有变构调节作用，多亚基构成的聚合体: 含有催化亚基（结合底物)， 和调节亚基（结合变构剂）。 这催化和调节 可以在不同的亚基上， 或者在同一亚基的两个不同部位。 变构剂(allosteric effector) ——凡能使酶分子构像改变并改变其催化活性的物质 变构激活剂?allosteric effector? ——引起酶活性增加的变构剂。 变构抑制剂?allosteric effector? ——引起酶活性降低的变构剂。 蛋白激酶A的变构调节 例磷酸果糖激酶： ATP是其变构抑制剂， 而ADP、