高级植物生理学第章 植物生理与分子生物学.ppt

高级植物生理学（专题一）植物生理与分子生物学 二、高等植物基因结构及表达调控 1、真核基因组结构特征 2、植 物 的 基 因 组 3、植 物 基 因 的结构 4、植物基因的表达调控 2、植物的基因组 基 因 （gene）？ 基因组 （genome）？ 基因组学 （genomics）？ 基因组：一个生物遗传物质的总和。 细胞中的全部DNA。 2.1 植物基因组的复杂性 叶绿体基因组（chloroplast genome）： 多数 被子植物 cpDNA在120~160kb之间； 含有87~183个已知基因； 线粒体基因组（mitochondrial genome） 叶绿体、线粒起源：马古利斯的内共生理论 2.2 基因组学简介 基因的命名： 3 植物基因的结构 ② 根据蛋白质测序结果，合成一对 或数对PCR 引物，以植物总DNA为模板，扩增出目标基因片段。 ③ 基因产物不明，但知道基因突变后的表型，可用转座子标签法分离基因。 ④ 利用RFLP图谱，找出与所要克隆基因紧密连锁的分子标记，用染色体步行法找到所要克隆的基因。 3.1 5’上游区: 转录起点5’端上游一段很长的区域，包含启动子在内的与基因表达起始和表达调控有关的许多元件。 3.2 5’非翻译区: 转录起点到翻译起始密码子之间的序列。该序列 5’端是前体 mRNA 加帽位点。 3.3 编码区: 内含子共有4种，具有核酶性质： I 类内含子： 主要存在于rRNA和质体tRNA基因 中， 中间部分高度保守； II 类内含子：主要存在于线粒体和质体mRNA基 因中，拼接点的序列高度保守； III 类内含子：主要存在于核mRNA基因中； IV 类内含子： 存在于核tRNA基因中； 3.4 3’非翻译区: 4 植物基因的表达调控 确定某种基因在何种组织专一表达的方法： ② Northern 原位杂交 ③ P2基因： 编码一种参与花粉管萌发生长的蛋白质，只在雄蕊成熟花粉与花粉管中表达。 ④ PAL2基因： 编码PAL，参与花色素形成，只在花瓣中表达。 4.2 受环境影响而表达的基因 拟南芥中的冷调节蛋白 COR6.6、油菜的BN28 蛋白与鱼类抗冻蛋白有同源性，体外实验表明冷调节蛋白能减少冻融过程对类囊体膜伤害。 拟南芥叶绿体的 CORl5 蛋白在体外能有效地防止乳酸脱氢酶因冰冻而失活，其效率较蔗糖高出106倍，较其它蛋白高102倍～103倍 。 ③ 水分逆境诱导的基因： 4.3 植物基因表达调控机理 （1）调控的特点（方式）： 染色质水平的调控； 以正调节为主，具有多个调控序列； 调控区很大，远离启动子几百至上千个bp； 存在多种转录后的调控机制； 具有细胞特异性或组织特异性表达； （2）顺式作用元件与基因表达调控 启动子： （3）反式作用因子与基因调控 RNA pol II 的相关转录因子有三类： （5）染色质活化与基因表达 （6）转录后水平调控 ① 5’-端加帽(capping)： ② 3’-端加尾（poly(A)）： ③ hnRNA的剪接 ——剪除内含子，并将外显子连接。 （7）翻译水平调控 影响翻译效率的因素有： ① 蛋白质因子和 tRNA浓度； ② 起始因子的可逆磷酸化作用； ③ mRNA结构——5’端帽 子和 3’端poly(A)尾巴 ； ④ mRNAR 的稳定性。 （8）翻译后调控 ① 氨基酸侧链的共价修饰： 乙酰化、磷酸化、糖基化； ② 蛋白质前体的切割和成熟。 ③ 蛋白质的分泌和胞内定位