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常见的基于核磁共振技术的代谢组学研究进展
* * 3. 病理诊断及病理生理学 代谢组学相对于基因组学研究来说,在疾病(如癌症,糖尿病,心血管疾病,肥胖,哮喘)领域是一个相对较新,不断获得更加广泛认可的分析方法。利用代谢组学的方法可以实现对疾病的诊断,通过对生物标记物的寻找和相关代谢网络的研究,探寻生物标记物的代谢途径和疾病的产生机理,实现对疾病的诊断。 1957年, “NMR医学研究系” 1979年,利用体液的氢谱对癌症进行诊断 1986年,利用人血浆中脂蛋白峰的甲基和亚甲基的线宽区别进行恶性肿瘤的诊断 近年来,通过对血浆、血清、脑脊液、卵巢囊液、组织液、鼠肝提取液的NMR分析,对体液NMR技术进行癌症或一些特异的肿瘤如:子房瘤、卵巢瘤、脑瘤、肝脏淋巴瘤、中枢神经系统恶性胶质瘤进行检测诊断的可能性进行了研究。 临床和生化研究的一个重要领域:利用高分辨NMR技术研究慢性肾功能衰竭(chronic renal failure, CRF)者的生化异常。 利用NMR技术可以研究先天性代谢失常,包括2-羟基戊二酸尿症、棕色糖尿病、酪氨酸血症、先天性血色沉着病、先天性尿道钙结石,在其它疾病如脑白质病、糖尿病、神经病等方面也取得了一些有益的研究成果。 例1. Urine samples – Cataract(白内障) Cataract (48) Control (48) 例2. Serum samples-cardiovascular disease (冠心病) Brindle JT et al., 2002. Nat Med. 8(12), 1439-45. 4. 食品安全及质量控制 目前对饮食的安全可靠性和食品的质量控制引起了科学领域和公众的特别关注,促进了在食品领域的代谢组学分析和对其质量控制方面的研究。 目前主要研究方向:酒精饮料和酿造食品(啤酒、葡萄酒、蒸馏酒、酱油、醋),咖啡和茶类,水果和蔬菜(果汁、柑橘、猕猴桃、芒果、黑树莓、甜瓜、西瓜、西红柿、莴苣、芸苔、土豆、胡萝卜、玉米、小麦),橄榄油,牛奶和乳制品(牛奶、奶酪、黄油和人造黄油),蜂蜜,鱼和肉类。还有其它的研究如松露、菌类和藏红花。 PCA (A) and OPLS-DA (B) 3D score plots derived from the 1H NMR spectra of beef sirloin (or chuck) extracts obtained from Australia, Korea, New Zealand, and the United States of America. 例1. Extracts from beef sirloin (牛里脊肉) 例2. Beer(啤酒) The same company, protocol (Genome), pipe-line (Proteome), but different taste (Metabolome) 例3. Wine(葡萄酒) Red wine More tannins and phenolics White wine More amino acid 例4. 蜂蜜(Honey) CJ (Chinese jujube,枣花), LJ (Lonicera japonica,金银花), FS (Flos sophorae,槐花), FCI (Flos chrysanthemi indici,菊花), EJ (Eriobotrya japonica,枇杷) 不同花蜜的NMR谱 例4. 蜂蜜(Honey) 相同产地 不同花源 相同花源 不同产地 相同厂家 不同批次 5. 营养代谢研究 代谢组学的方法可以帮助识别和常量营养物的最终摄入效应密切相关的代谢物,并且有助于定义各种常量营养物的正常摄入范围。营养代谢组学(Nutrimetabolomics)定义的提出。 饮食与营养科学与代谢组学相结合系统地表征在不同健康状态(健康,亚健康,疾病)下,饮食习惯,地域差异,营养结构(种类和用量),营养相关疾病等对机体造成的细微代谢变化,这些变化概况为探索不同饮食或营养条件下机体内的细胞,组织和器官的生物标记物,代谢整体水平以及代谢作用机制,并有可能为机体的健康状况动态地况进行诊断和营养搭配提供新的策略。 6. 功能基因组的研究 随着人类基因组测序工作的完成,人们已经步入到了后基因组时代即对功能基因组学的研究。通常,功能基因组学利用基因组提供的信息和产物,运用遗传或其他新的实验技术,通过识别基因在一个或多个生物模型中的作用来全面认识和分析基因的功能。 基因产生变异的生物体在生长速率等表型上可能没有显著的改变,这是因为细胞内的代谢物浓度的改变补偿了
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