玉米泛素活化酶基因家族鉴定及表达模式分析.PDFVIP

玉 米 科 学2018，26(1)：8～14，19 JournalofMaizeSciences 文章编号：1005-0906(2018)01-0008-07 DOI:10.13597/ki.maize.science 玉米泛素活化酶基因家族鉴定及表达模式分析 赵秋芳，贾利强，马海洋，陈 曙，陈宏良 (中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室，广东 湛江 524091) 摘 要：通过生物信息学分析，从B73玉米全基因组中鉴定出4个泛素活化酶基因，分别命名为ZmUBA1～ ZmUBA4。4个ZmUBA基因编码氨基酸数目在1030～1056aa，编码蛋白分子量在114.63～117.39kD，等电点在 5.18～5.80，且均含有5个内含子。蛋白二级结构预测，4个基因编码的蛋白主要以α–螺旋和不规则卷曲为主，亚细 胞定位预测4个基因均定位于细胞核中。荧光定量PCR结果表明，ZmUBA1基因在根、茎、叶、雄穗和雌穗中呈现组 成性表达，ZmUBA2和ZmUBA4基因在雄穗表达量最高，ZmUBA3在叶片表达量最高，呈现组织特异性表达。ZmUBA3 在盐和低温胁迫上调表达，ZmUBA4在盐胁迫时下调表达，说明ZmUBA3基因可能参与玉米低温和盐胁迫的应答， ZmUBA4可能参与玉米盐胁迫应答。 关键词：玉米；泛素活化酶；生物信息学；基因表达 中图分类号：S513.035.3 文献标识码：A IdentificationandExpressionAnalysisoftheUbiquitin ActivatingEnzymeGeneFamilyinMaize ZHAOQiu-fang,JIALi-qiang,MAHai-yang,CHENShu,CHENHong-liang (InstituteofSouthSubtropicalCorpResearch,ChineseAcademyofTropicalAgriculturalScience/ KeyLaboratoryofTropicalFruitBiology,MinistryofAgriculture,Zhanjiang524091,China) Abstract:Fourubiquitinactivatingenzyme(UBA)geneswhichdesignatedasZmUBA1-4wereidentifiedfrom thewholegenomeofB73 maizebyusingbioinformaticsmethod.Thepolypeptidelengthsofthe ZmUBA genes rangedfrom 1030aato 1056aa,andtheirpredictedmolecularweightsrangedfrom 114.63kDto 117.39kD.The predictedpIhadarangeof 5.18to 5.8,andalloftheZmUBA genescontained 5introns.Thepredictedsecondary structuresuggestedthatthemainstructureoffourproteinswerealphahelixandrandomcoil.Thesubcellularlocal⁃ izationanalysisshowedthatalloftheZmUBAproteinswerelocatedinthenucleus.Real-timeqPCRassayshowed that ZmUBA1genewasco-expressedinroots,stems,leaves,malespikesandfemaleears,thehighestexpression levelofZmUBA2 andZmUBA4 wereoccuredinthemalespikesand ZmUBA3 occuredinleaves,andthreegenes showedti