干扰历史对沙松小尺度遗传结构影响.pptVIP

* 干扰历史对沙松小尺度遗传结构的影响 K. C. Parker, J. L. Hamrick, A. J. Parker, J. D. Nason. Fine-scale genetic structure in Pinus clausa (Pinaceae) populations: effects of disturbance history. 2001. Heredity 87:99-113 王红芳 2006-11-15 Pinus clausa 物种分布 取样种群位置 var.immuginata var. clausa 取样种群基本信息 不同年龄级个体组成情况 拟解决的问题 每个种群内，空间相似的个体是否具有更相似的遗传组成？ 同一种群内，不同年龄组是否具有不同的小尺度空间遗传结构和近交格局？ 不同种群的空间遗传结构的差别是否与种群间成年树木和幼苗密度的差别有关？ 两个变种遗传结构强度是否有差别，这种差别与干扰历史是否相关？ 推测 var. clausa更新时间短，种子源比较单一，所以可能缺乏空间遗传结构； var. immuginata具有连续的林隙更新，两个变种花粉和种子扩散在时间和空间上存在差别，这可能使var. immuginata比var. clausa具有更强的空间遗传结构； 多态位点百分比P：（多态位点数目/总共检测的位点数） 每个位点平均等位基因数A; 期望杂合度/遗传多样性He: 固定指数; FIS = (HS - HI) / HS?? 共祖系数； 遗传距离Gst (Nei 1973): 分子数据统计指标 种群：遗传多样性、近交水平以及遗传距离分析（近交系数、Hardy-Weinberg平衡检验、GST） 老龄林和更新林的比较，不同干扰体系的种群比较。 卡方检验，p=0.05 个体：空间遗传结构(多位点共祖系数与个体间间距的相关性) 距离等级：间距5米为递进单位。 统计方法 种群基因组成信息 近交水平 FIS = (He - Ho) / He FIS大部分与0值无显著偏离； 单位点分析，大部分显著的FIS值为正值（3倍负值），杂合度不足现象更加普遍； 大部分符合H-W平衡的随机分布（仅9.5%显著偏离这种平衡分布。） 近交水平 可能原因： 很强的花粉流可能增强了遗传多样性，避免了近交； 近交可能在苗早期就已经历了快速选择而被消除。 遗传距离GST 同一种群内幼苗和成年树木的遗传距离很小（GST0.003）; 同一种群不同年龄的立地间遗传距离较上者偏大（ 0.003 GST0.008 ）. 小尺度空间遗传结构（个体水平）——不一致 个体间距离 共祖系数 GIN HHY JDY RSY GIN HHY JDY RSY 小尺度空间遗传结构（个体水平）——不一致 小尺度空间遗传结构（成年个体和幼苗遗传结构的差别） GIN幼苗 GIN成年树 JDY幼苗 JDY成年树 RSY成年树 RSY幼苗 小尺度空间遗传结构——可能原因 成年个体和幼苗的空间聚集情况： 例如：GIN, RSY, JDY, RSO, HHO, JDO 例外：HHY, EOS, STJ 种子扩散限制使得空间聚集的同一年龄级的个体具有更大的遗传相似性； 个体竞争自梳现象使成年个体种群缺乏空间聚集现象，其基因型亦缺乏空间聚集结构；所以成年树木大多不具有空间遗传结构； 年间等位基因频率的变动可能是造成具有大量幼苗的EOS和STJ种群缺失遗传结构的原因 *