单核苷酸多态性与乳腺癌新辅助化疗疗效的关联分析-药学;药理学专业论文.docx

单核苷酸多态性与乳腺癌新辅助化疗疗效的关联研究 PAGE PAGE 1 中 文 摘 要 目的 利用甘肃省肿瘤医院乳腺科甘肃省乳腺病诊治中心和甘肃省医学科学院肿瘤 组织和淋巴细胞库资源，用 TaqMan OpenArray 基因分型系统联合检测与乳腺癌新辅 助化疗密切相关的基因及其 SNPs。 通过以下方面进行深入研究：1.探讨甘肃汉族妇 女乳腺癌患者新辅助化疗密切相关的基因的基因型分布。2. 通过基因及其 SNPs 的研 究，筛选新辅助化疗方案疗效和毒性相关的基因型分布。3. 筛选与乳腺癌新辅助化疗 方案疗效及预后相关的遗传标志物。 方法 依据不同的新辅助化疗方案遴选符合入组条件的乳腺癌病例，化疗前采集患者 外周静脉血 2 mL，利用北京百泰克公司 DNA 提取试剂盒提取基因组 DNA；提取的 DNA，采用 ND 2000 超微量分光光度计检测其浓度，要求所有 DNA 样本浓度为 20~80 ng/μL，OD 值在 1.7~2.0 之间；分装于 1.5 mL Eppendorf（EP）管中，-80℃冰箱保存 备用；用美国应用生物系统（Applied Biosystems，AB）的 TaqMan 技术，采用 TaqMan OpenArray 基因分型系统实施 SNPs 分析；所有患者按照 RECIST 标准评价疗效；随 机选取 5%的 DNA 样本送金维智公司进行 PCR 测序分析，以验证 Taqman Openarray 基因分型结果的可靠性；采用χ2 检验比较各基因型化疗效果差异及疗效关系，分析基 因型分布频率。 结果 1.MDR1 rs1045642 各基因型频率分别为 AA（18.1%），AG（41.8%），GG（40.1%）； MDR1 rs1128503 各基因型频率分别为 AA（38.1%），AG（46.9%），GG（15.0%）； CD44 rs187115 各基因型频率分别为 CC（8.6%），CT（29.8%），TT（61.6%）。 2.186 例乳腺癌新辅助化疗患者中，化疗受益（CR+PR）为 82 例，总有效率为 44.1%； TNM 分期中，II 期患者比例为 44.6%，III 期患者比例为 53.2%，IV 患者比例为 2.2%。 卡方检验显示，患者年龄、TNM 分期与化疗疗效均无明显相关性（p0.05）。 3.在 MDR1 基因型 rs1045642 位点中，野生型（AA）、杂合型（AG）、突变型（GG） 的受益率分别占总受益率的 10.7%、17.5%、16.4%；AG 型与 AA 型比较，差异无统 计学意义（p=0.098），GG 型与 AA 型比较，差异无统计学意义（p=0.081）。在 MDR1 基因型 rs1128503 位点中，野生型（AA）、杂合型（AG）、突变型（GG）的受益率 分别占总受益率的 21.1%，17.1%，5.4%；AG 型与 AA 型比较，差异有统计学意义 （p=0.032），提示 AA 型的化疗效果优于 AG 型，GG 型与 AA 型比较，差异无统计 学意义（p=0.131）。在 CD44 基因型 rs187115 位点中，野生型（CC）、杂合型（CT）、 突变型（TT）的受益率分别占总受益率的 4.0%，11.9%，28.5%；CT 型与 CC 型比较， 差异无统计学意义（p=0.692），TT 型与 CC 型比较，差异无统计学意义（p=0.996）。 4. MDR1 rs1045642 GG 基因型与中性粒细胞减少症相关，III-IV 度的发生率为 2.8%（2/71），明显低于 AA（9.4%）和 AG 型（20.3%），χ2=7.188，p=0.027。未发 现 MDR1 rs1045642 多态性与血红蛋白减少、白细胞减少及血小板减少之间的关系。 MDR1 rs1128503 GG 基因型与中性粒细胞减少症相关，III-IV 度的发生率为 4.5% （1/22），明显低于 AA（10.8%）和 AG 型（27.5%），χ2=9.077，p=0.011。未发现 MDR1 rs1128503 多态性与血红蛋白减少、白细胞减少及血小板减少之间的关系。 CD44 rs187115 TT 基因型与白细胞减少症相关，III-IV 度的发生率为 2.2%（2/93）， 明显低于 CC（23.1%）和 CT 型（6.7%），χ2=10.194，p =0.006。未发现 CD44 rs187115 多态性与血红蛋白减少、中性粒细胞减少及血小板减少之间的关系。 结论 基因芯片检测方法简单快速且高通量，适用于大规模样本 SNP 调查；MDR1 rs1045642 位点、CD44 rs187115 与化疗敏感性无关、MDR1 rs1128503 位点 AA 型