生物信息的传递-MRNA到蛋白质
第四章 生物信息的传递(下) ―――从mRNA到蛋白质 1、遗传密码 2、 tRNA 3、核糖体 4、蛋白质合成的生物学机制 5、蛋白质运转机制 蛋白质的生物合成步骤: (1)翻译的起始:核糖体与mRNA结合并与氨酰-tRNA生成起始复合物。 (2)肽链的延伸:由于核糖体沿mRNA5’端向3’端移动,开始了从N端向C端的多肽合成,这是蛋白质合成过程中速度最快的阶段。 (3)肽链的终止及释放:核糖体从mRNA上解离,准备新一轮合成反应。 遗传密码表 ORFs 从mRNA 5?端起始密码子AUG到3?端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(open reading frame, ORF)。 An ORF is a suspected coding region. 其中, A位点 (氨酰基位点,与新掺入的氨酰tRNA结合);P位点(肽酰基位点,与延伸中的酰肽tRNA结合);E位点(肽酰转移后即释放tRNA位点)。 tRNA的移动顺序是: A位点--- P位点--- E位点。 蛋白质的降解是一个精细控制的过程,首先蛋白质被一种多肽(称之为泛素---Ubiquitination )所标记,接着这些蛋白质进入细胞的蛋白酶复合体中,蛋白酶复合体是一个上下有盖的圆桶状酵素,如同细胞的垃圾桶,专门负责蛋白质的分解及再循环利用,泛素释出讯号,让蛋白酶复合体分辨出有待降解的蛋白质。 意义: (1)清除错误蛋白; (2)调控细胞生长周期\DNA结构\染色体结构; (3)了解重要生理过程分子机理; (4)新药开发。 复习思考题 1、名词解释: 泛素(Ubiquitination) 信号肽( signal peptide ) 分子伴侣(molecular chaperones) SD序列 校正tRNA 密码的简并性(degeneracy) 开放阅读框架(open reading frame, ORF) 2、简述泛素介导的蛋白质降解的机制和意义。 3、简述核定位蛋白的运转过程。 4、简述前导肽的作用与性质。 5、叶绿体蛋白质的跨膜运转机制。 6、线粒体蛋白质跨膜机制。 7、简述新生蛋白质通过同步转运途径进入内质网内腔的主要过程。 8、简述蛋白质的生物合成基本过程。 肽键的生成 经过上一步反应后,在核糖体·mRNA·AA-tRNA复合物中,AA-tRNA占据A位,fMet-tRNA fMet占据P位。 在肽基转移酶的催化下,A位上的AA-tRNA转移到P位,与fMet-tRNA fMet上的氨基酸生成肽键。 A位点腾空准备接受新的AA-tRNA,进行下一轮合成反应。起始tRNA则离开了核糖体P位点。 * * 移位 肽键延伸过程中最后一步,核糖体向mRNA3’端方向移动一个密码子。此时,仍与第二个密码子相结合的二肽基tRNA,从A位进入P位,去氨酰-tRNA被挤入E位,mRNA上的第三位密码子则对应于A位。 * * 4. 肽链的终止 当终止密码子UAA、UAG或UGA出现在核糖体的A位时,没有相应的AA-tRNA能与之结合,而释放因子能识别这些密码子并与之结合,水解P位上多肽链与tRNA之间的二酯键,释放新生的肽链和tRNA,核糖体大、小亚基解体,蛋白质合成结束。 * * * * 释放因子RF具有GTP酶活性,它催化GTP水解,使肽链与核糖体解离。 细菌细胞内存在三种终止因子(或称释放因子,RF1,RF2,RF3)。一旦RF与终止密码相结合,它们就能诱导肽基转移酶把一个水分子而不是氨基酸加到延伸中的肽链上。 RF1能识别UAG和UAA, RF2识别UGA和UAA, RF3可能与核糖体的解体有关。 真核细胞只有一个(RF)终止因子。 5. 蛋白质前体的加工 新生多肽链大多数是没有功能的,必须经过加工修饰才能转变为有活性的蛋白质。 N端fMet或iMet的切除 二硫键的形成 特定氨基酸的修饰。氨基酸侧链的修饰包括: 磷酸化(如核糖体蛋白质)、 糖基化(如各种糖蛋白) 、 甲基化(如组蛋白、肌肉蛋白质) 、 乙基化(如组蛋白) 、 羟基化(如胶原蛋白)和竣基化等。 切除新生链中非功能片段 * * 6. 蛋白质的折叠 新生多肽链必须经过正确的折叠,才能形成动力学和热力学稳定的三维构象,从而表现出生物学活性或功能。 多肽链的折叠式一个复杂的过程,新生肽链一般首先折叠成二级结构,再进一步折叠盘绕成三级结构。对
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