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基于粒度空间的最小生成树分类算法
( )
南京大学学报 自然科学
第 卷 第 期 ,
53 5 Vol.53 No.5
JOURNALOFNANJINGUNIVERSITY
年 月 ,
2017 9 Set.2017
p
( )
NATURALSCIENCE
: /
DOI10.13232 .cnki.nu.2017.05.016
j jj
基于粒度空间的最小生成树分类算法
,
1 12*
,
孙梦梦 唐旭清
( , , ; , , )
1.江南大学理学院 无锡 2141222.无锡市生物计算工程技术研究中心 无锡 214122
: ,
摘 要 基于粒度空间理论 进行了基于归一化距离的最小生成树分类算法研究 首先根据类内偏差和类间偏差的
.
, , ,
性质 在已有的粒度空间生成算法的基础上 引入最小生成树以及新的最优聚类指标 给出了基于归一化距离的最
, ,
小生成树分类算法 并建立了最优聚类模型 其次 将模型应用于研究从 上下载的 年间的 条
. NCBI 1902-2015 898
, , , , , ,
现在已经确认能够感染人的禽流感病毒蛋白质序列 与 蛋白 共有 种 包括
HA NA 8 H5N1H5N2H7N2H7N3
, , , , ,
以及最近的 在距离中心最近的基础上 通过运行最小生成树分类算法 个代表病毒
H7N7H9N2H10N7 H7N9. 6
, , , 、
序列被选出 并且得到了最优层次结构 最后 对实验结果进行分析 结果表明病毒爆发地域差异 病毒爆发时间等
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