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- 2018-12-10 发布于江苏
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1-秦晓峰-组学大数据平台在肿瘤精准医疗中的应用教案
Chinese Academic of Medical Science
Center of System Medicine
组学大数据平台在肿瘤精准医疗中的应用
秦晓峰
中国医学科学院医学生物信息大数据中心苏州系统医学研究所
医疗行业产生大量数据
临床数据来源和分析
临床数据来源:
年龄
性别
过敏情况
药物测试
疾病详情
家族史
药物接受和排斥
曾使用剂量水平生存率诊断测试
手术
临床数据分析:
生存分析
预测
组学数据来源和分析
宏基因组深度挖掘
多组学联合分析
微生物组在肿瘤免疫治疗中的应用
期刊:Science
发表时间:2017.11
实验设计:249名接受过抗PD-1免疫疗法的肺癌、肾癌等多种不同的癌症;免疫治疗前69名患者接受了抗生素的治疗;
研究技术:粪便宏基因组测序
验证:无菌小鼠FMT(粪菌移植)验证;
结果:1)抗生素治疗的患者,癌症很快出现复发,生存时间也更短;
2)恢复较好的患者体内,Akkermansia muciniphila的益生菌丰度更高,对癌症免疫疗法还有促进作用;
3)接受了“起效者”粪便的小鼠对于PD-1抑制剂的反应要明显优于接受了“无效者”粪便的小鼠,后者在
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