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2018-12-17 发布于湖北
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基因功能跟通路分析技术.pdf

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基因功能跟通路分析技术

基因功能与通路分析技术主讲人：李春权 Cancer information flow ：Two lines Life line： + ways 病前期早期中期晚期终末期 Mechanism line： Analysis ways ： Single( SNP/Gene /Tf/miRNA…) multi- ( SNP/Gene /Tf/miRNA…) system 功能模块代谢通路内容目录 • 功能数据库和通路数据库简介√ • 疾病风险基因的功能注释及通路注释 • 疾病风险基因集合的功能富集分析 • 疾病风险子通路识别方法葡萄糖代谢通路葡萄糖 6-磷酸葡萄糖 6-磷酸果糖 1,6-双磷酸果糖 2-磷酸甘油酸 3-磷酸甘油醛烯醇化酶 1,3-二磷酸甘油酸磷酸烯醇式丙酮酸 3-二磷酸甘油酸丙酮酸激酶丙酮酸 http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?org_name=rnmapno=00010mapscale=1.0show_description=show 非代谢通路（信号转导通路等）激活磷酸化 MAPK通路绑定/相关 http://www.genome.jp/kegg/pathway/hsa/hsa04010.html 节点间的各种关系通过这些详细的互作关系，我们能够更清晰的了解通路！ http://www.genome.jp/kegg/document/help_pathway.html Detail： http://www.genome.jp/kegg/xml/docs/ 泛素化激活去磷酸化抑制绑定/相关磷酸化 http://www.genome.jp/kegg/pathway/hsa/hsa04630.html 通路数据库 KEGG http://www.genome.jp/kegg/ 其它通路数据库： biocarta / wikipathways /index.php/WikiPathways Reactome /ReactomeGWT/entrypoint.html