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基于聚合信息量的本体语义相似性度量基于聚合信息量本体语义相似性度量
基于聚合信息量的本体语义相似性度量姓名: 学号: 指导教师: 答辩提纲课题背景工作内容算法设计算法实现算法评估课题背景基因本体(Gene Ontology,GO)语义相似性(Semantic Similarity)信息量(Information Content,IC)基因本体(GO)信息量(IC)?工作内容AICSI算法过程AIC算法与SI算法AIC算法:SI算法: AIC算法?测量蛋白质相似性:SI算法? GO条目相似性:SI算法?AIC算法实现AIC算法评估?Resnik方法:Jiang方法:AIC算法评估?Lin方法:Wang方法:AIC算法GO语义相似性评估方法结果Resnik1.047Lin0.424Jiang0.26Wang0.797SI0.499AIC0.902AIC算法GO语义相似性评估比较不同层但距离相同的两组数据ACI基因相似性算法评估术语1术语2ResnikLinJiangWangSIAICGO:0044424GO4300.9180.9280.8450.8800.898GO:0044444GO8210.8790.8150.8790.8770.939测试结果:蛋白质相似性评估ROCAUCPPIMIPS平均法(AIC)测蛋白质蛋白质相似性评估谢谢各位答辩老师的指导!基因本体是为了实现对各种数据库中基因产物功能描述相一致而产生的本体。基因本体包括一个术语的信息量与这个术语在指定语料库中用于注释基因的频率成反比。一个条目的信息量基于它出现在一个组中的可能性一个条目的信息量基于它出现在一个组中的可能性建立好MP.sqlite后,打包MP.db,细节过程略
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