两品种牛可脂肪组织mirna的鉴定及bta.docxVIP

Secrecy： No． - Chinese Academy of Agricultural Sciences Dissertation Identification of miRNAs in Adipose Tissues from Two Breeds of Cattle and Bioinformatics Analysis of Bta--miR--320a M．S．Ca ndidate：Yuntao Guo Adv iso r：P rof．Xiangyang Miao Major： Anima l Ge netics， B reeding and Re production Sc ience Specialty： Molecular Biology May 2015 万方数据  独创性声明 本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成 果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发 表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或汪 书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了 明确的说明并表示了谢意。 研究生躲吻}，易确 刚司：姚年川。日 关于论文使用授权的声明 本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定，即：中国农业科 学院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩 印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不 同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。 研究生签名：嚼P云；旁 时间： 加，s年岁月≥。目 导师签名： 蕾叩 时间：zoty年厂月弘日 万方数据  中国农业科学院 硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表 论文题目 两品种牛脂肪组织miRNA的鉴定及bta．miR．320a的生物信息学分析 动物遗传育 动物基因工程 论文作者 郭云涛 专 业 研究方向 种与繁殖 与细胞工程 中国农业科学院北京 指导教师 苗向阳 培养单位(研究所) 畜牧兽医研究所 硕(博) 姓名 职称 单 位 专 业 签名 导师 评 孙东晓 教授 硕导口 中国农业大学 动物遗传育种与繁殖 ＼ 博导面 硕导口 ＼ 阅 人 李祥龙 教授 博导日 ??北科技师范学院 动物遗传育种与繁殖 答 辩 硕导口 囝峙 主 田见晖 教授 博导呼 中国农业大学 动物遗传育种与繁殖 席 硕导口． ＼ 豁 刘维全 教授 博喜西 中国农业大学 生物化学与分子生物学 尹 L 硕导口 放 胡晓湘 教授 中国农业大学 生物化学与分子生物学 辩 寿伟年 教授 博导q 中国医学科学院 细胞和分子生物学[ 船 口 博导一 捌0I阮玄所 硕导口 委 郑乐民 教授 博导西 北京大学 病理生理学 郜双J 贝 朱德生 教授 硕导囵 北京大学 实验动物学 躺杉 缈} 博导口 、 ， 韩建林 研究员 硕导口／ 博导一 国际家畜研究所 动物遗传育种与繁殖 会议记录(秘书) ‘癜秀 论文答辩时间地点 2015年5月29日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所科研楼会议室 万方数据  摘要 日本黑毛和牛与荷斯坦牛同为世界知名牛种，但是在脂肪沉积方面二者却形成了显著差异， 这就为牛脂肪沉积相关研究提供了优良的素材。因此，本实验旨在利用RNA-Seq方法对两个品 种牛背部皮下脂肪组织miRNA表达情况进行比较研究，以期鉴定出调控牛脂肪沉积的miRNAs， 为牛脂肪沉积机理的研究和肉牛种质资源利用提供理论基础。分别采集健康、体况良好、品种内 不同个体体重相近的处于屠宰期(约34月龄)5头日本黑毛和牛和5头荷斯坦牛的背部皮下脂肪组 织，构建两个品种small RNA的cDNA混合文库w和H，然后对其进行Illumina测序，进而对 测序数据进行生物信息学分析。从W和H文库中分别获88．32％)和9417372(85．960,6) 条clean reads，鉴定出bta-miR-30f、bta-miR．196b和bta-miR-2887等14个上调表达miRNA，3 个下调表达miRNA bta-miR．320a、btvm iR-874和bta-miR-1 247—3p，预测出l 5个新miRNA。通 过对17个己知差异表达miRNA的靶基因进行预测共获得1345个可能靶基因，其中包括APOAl、 APOA5、ANGPTL4、PPARa、RXRa和CDKllB等己报道参与脂肪细胞分化和脂代谢调控的基因， 这些靶基因富集在脂肪酸代谢和细胞周期调控等生物过程以及甘油磷脂代谢和PPAR等信号通路 中。由此推测：bta-miR-30f、bta-miR-196b、bta-miR．320a和bta-mi