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- 约 59页
- 2018-12-22 发布于福建
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石家庄地区结核分枝杆菌临床分离株基因分型及耐药性分空析-病原生物学专业毕业论文
河北医科大学
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年囊月-’日
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研究生签名: 导师签章:名矾
年 月 日
万方数据
目
目 录
中文摘要 一1
英文摘要 一4
英文缩写 一7
研究论文石家庄地区结核分枝杆菌临床分离株基因分型及耐药性分析
前言翮舌 一一9
材料与方法 一10
结果 一18
附图 一24
附表 一28
讨论 ..42
结论 一45
参考文献 一46
综述结核分枝杆菌基因分型技术研究进展 51 致谢 一56
个人简历 一57
万方数据
中文摘要石家庄地区结核分枝杆菌临床分离株基因分型及耐药性分析
中文摘要
石家庄地区结核分枝杆菌临床分离株基因分型及耐药性分析
摘 要
目的:对石家庄地区结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型研究和药 物敏感性试验,分析了石家庄地区结核分枝杆菌基因多态性和分子流行病 学特征,及石家庄地区结核分枝杆菌临床分离株的耐荮隋况以及耐药菌株 基因分型特征,有助于对石家庄地区结核病的流行发展趋势的充分了解, 为结核病的有效防治提供科学依据。
方法:收集2014年1月至2014年10月期间在石家庄市第五医院就 诊的结核病患者经临床分离培养得到的结核分枝杆菌菌株及相应病例背 景资料,采用PNB/TCH初步鉴别法和多位点PCR(Multi.10cus PCR) 进行菌种鉴定。采用比例法进行一线抗结核药(链霉素、异烟肼、利福平、 乙胺丁醇)的药物敏感性试验。应用间隔区寡核苷酸基因分型
(Spoligotyping)和15位点数目可变串联重复序列分析(VNTR)进行菌 株的基因分型。运用BioNumerics 5.0软件进行聚类分析,运用SPSS 16.0 软件进行Hunter-Gaston分辨指数(HGDI)计算和卡方检验(计数资料)、 t检验(计量资料)等数据分析。
结果: 1收集到石家庄地区结核分枝杆菌培养阳性共373株,经过PNB/TCH
和多位点PCR实验证实为结核分枝杆菌有367株和非结核分枝杆菌6株。
2间隔区寡核苷酸基因分型法(Spoligotyping)
367株结核分枝杆菌呈现明显的基因多态性。通过比对SpolDB4.0数据 库,可分为2个基因群,即北京家族(Beijing family)和非北京家族 (Non—Beijing family),分别占91.3%(335/367)和5.7%(21/367)。有 1 l株(3.O%)的基因型不能被SpolDB4.0数据库所识别,可能为新的基因型。 北京家族菌株中99.4%(333/335)为典型北京家族(Typical Beijing family), 表现为仅与35--,43之间的9个间隔区呈现阳性杂交反应;其余菌株在35,-一 43之间有l~4个位点呈现阴性杂交反应,称为非典型北京家族(Atypical
Beijing family)或北京样基因型(Beijing.1ike family)。非北京家族菌株
表现出高度的基因多态性,包括T基因型,占66.7%(14121);MANU基
万方数据
中文摘要
中文摘要 因型,占14.3%(3/21);LAM基因型,占14.3%(3/21);H基因型,占 4.7%(1/2 1)。经BioNumerics软件聚类分析,全部29种基因型包含1 0个 簇和147种独特基因型(单一菌株类型)。其中最大的一个簇含331株(90.2
%),为北京家族基因型。Spoligotyping对所有菌株的HGDI值为0.2486。
3数目可变串联重复序列分析(帅)
经BioNumerics软件聚类分析,367株结核分枝杆菌可分为194种VNTR
基因型,其中221(60.22%)株菌可被聚类为48个簇,146(39.78%)种 基因型为独特基因型;335株北京家族菌株呈现161种VNTR基因型,其中 219(65.37%)株可聚为45个簇,1 16(34.63%)为独特基因型。VNTR
对所有菌株的HGDI值为0.9838,VNTR和Spoligotyping联合使用时,I-IDGI
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