核酸序列检索与分析.pptxVIP

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核酸序列检索与分析

核酸序检索 启动子序列定位及功能预测 基因表达读框分析 核酸局部序列比对分析;;主要数据库介绍;Genebank Genebank库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列,以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。 NCBI的网址是:;;;NCBI介绍:NCBI建立在1988年,作为一种公共分子生物学信息资源, 而创建的公开数据库。 NCBI的计划:1.基本研究;2.数据库;3.软件的开发;4.教育和训练;现在我们以查找“大鼠心肌肌凝蛋白轻链2”的基因序列为例,介绍如何从NCBI中在线获取所需要的核酸序列. 大鼠心肌肌凝蛋白轻链2(其英文名称为:myosin light chain 2,Myl2);;;;;;;;;;; 核酸序检索 启动子序列定位及功能预测 基因表达读框分析 核酸局部序列比对分析;启动子序列定位及功能预测;;根据基因调控在同一时间中的先后次序,又可将其分为: ???录水平调控(transcription regulation) 转录后水平调控(posttranscription regulation) 翻译水平调控(translation regulation) 蛋白质加工水平调控(protein maturation)等。 它们均受到严格的调控。其中,转录水平的调控是最为有力的调控。;RNA 聚合酶;真核基因的启动子在-25~-35区域含有TATA序列,在-70~-80区域含有CCATT序列,在-80~-110含有GCCACACCC或GGGCGGG序列。习惯上,将TATA框上游的保守序列称为上游启动子元件(upstream promoter element,UPE)或称上游激活序列(upstream activating sequence,UAS). 然而,大多数的组织结构基因并没有严格地遵守上述规;;;;;;;; 核酸序检索 启动子序列定位及功能预测 基因表达的读框分析 核酸局部序列比对分析;基因表达的 读框分析;;;;;; 核酸序检索 启动子序列定位及功能预测 基因表达的读框分析 核酸序列比对分析;核酸序列的 比对分析;;运行时联网至:/BLAST  按照提示进行查询。;;;;;;;;;;;;谢谢 大家!

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