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第期电子学报年月基于码书索引变换的高通量序列数据压缩算法谭丽孙季丰华南理工大学电子与信息学院广东广州摘要提出一种高通量序列数据的压缩算法该算法先采用码书索引变换模型将传统码书索引值的表示方法变换成由四个标准碱基字符替代的四进制数值方式并采用一种界定替换串与非替换串的简明编码方法接着通过信息熵的大小来决定是否进行块排序压缩变换最后进行前移编码变换和熵编码在多种测序数据集上的实验结果表明在大多数情况下可以获得比本文所对比的高通量专用压缩方法更优的压缩性能关键词高通量序列码书索引变换模型块排序压缩变换
第 期 电 子 学 报
５ Ｖｏｌ．４３ Ｎｏ．５
年 月
２０１５ ５ ＡＣＴＡＥＬＥＣＴＲＯＮＩＣＡＳＩＮＩＣＡ Ｍａｙ ２０１５
基于码书索引变换的高通量 ＤＮＡ序列数据压缩算法
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