小麦SSR和EST ̄SSR引物对无芒雀麦的通用性分析-湖南师范大学.PDF

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小麦SSR和EST ̄SSR引物对无芒雀麦的通用性分析-湖南师范大学

植物科学学报  2014ꎬ32(1):27~33 Plant ScienceJournal     DOI:103724/ SPJ1142201410027 小麦SSR和 EST ̄SSR引物对无芒雀麦的通用性分析 1 2 2 2 2 2∗ 程雪妮 ꎬ王 颖 ꎬ庞玉辉 ꎬ陈新宏 ꎬ武 军 ꎬ赵继新 (1.西北农林科技大学生命科学学院ꎬ陕西杨凌 712100ꎻ2.西北农林科技大学农学院ꎬ陕西杨凌 712100) 摘  要:无芒雀麦(Bromus inermis Leyss.)具有营养价值高、 产量大、 利用季节长、 耐寒耐旱、 适应性强等优 良品质ꎮ 为了解小麦SSR和EST ̄SSR引物在亲缘植物无芒雀麦中的通用性ꎬ 本研究选用位于普通小麦7个部分 同源群的203对SSR引物和46对 EST ̄SSR引物对无芒雀麦基因组 DNA 进行了扩增ꎮ 结果显示: 有 137对 (6749%)SSR和30对(6522%)EST ̄SSR引物对无芒雀麦可以有效扩增ꎬ 平均扩增条带数分别为28和25ꎬ 即小麦SSR和EST ̄SSR引物在无芒雀麦中具有较高的通用性ꎻ 研究还发现ꎬ 来自小麦B基因组和第5 同源群染 色体的引物在无芒雀麦中的有效扩增比率和平均扩增条带数最低ꎮ 据此推断ꎬ 小麦 B基因组和第5 同源群染色 体可能与无芒雀麦基因组的亲缘关系较远ꎮ 该研究对开发无芒雀麦基因组的特异分子标记、 进行遗传多样性分 析和功能基因定位等具有一定的参考价值ꎮ 关键词:无芒雀麦ꎻ 小麦ꎻ SSRꎻ EST ̄SSRꎻ 通用性 中图分类号:S5121ꎻ Q9432          文献标识码:A          文章编号:2095 ̄0837(2014)01 ̄0027 ̄07 PrimerTransferability Analysis on SSRand EST ̄SSR Markers from Triticum aestivumto Bromus inermis 1 2 2 2 2 2∗ CHENGXue ̄Ni ꎬ WANGYing ꎬ PANGYu ̄Hui ꎬ CHENXin ̄Hong ꎬ WUJun ꎬ ZHAOJi ̄Xin (1. College of Life Scienceꎬ NorthwestA & F Universityꎬ Yanglingꎬ Shaanxi712100ꎬ Chinaꎻ 2. College ofAgronomyꎬ NorthwestA & F Universityꎬ Yanglingꎬ Shaanxi712100ꎬ China) Abstract:Bromus inermis Leyss. (bromegrass) is a species of the Bromeaetribeꎬ Poaceae. It has the advantages of high nutritional valueꎬ high yieldꎬ strong adaptabilityꎬ and long growing seasonꎬ and it is tolerant to abiotic stresses such as droughtꎬ coldꎬ salinityꎬ and infertile soils. In this paperꎬ 203 pairs of SSR and 46 pairs of EST ̄SSR primersꎬ designed from genomes Aꎬ Bꎬ and D of Triticum aestivumꎬ were employed to evaluate primer transferability inthe genomes of Binermis. Results showed that 137 (6749%) pairs of SSR and3

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