玉米种子萌发相关性状的全基因组关联分析.PDFVIP

作物学报 Acta Agronomica Sinica ISSN 0496-3490,CN 11-1809/S 《作物学报》网络首发论文 题目： 玉米种子萌发相关性状的全基因组关联分析 作者： 田润苗，张雪海，汤继华，白光红，付志远 收稿日期： 2017-11-02 网络首发日期： 2018-03-16 引用格式： 田润苗，张雪海，汤继华，白光红，付志远．玉米种子萌发相关性状的全基 因组关联分析．作物学报. /kcms/detail/11.1809.S0917.006.html 网络首发：在编辑部工作流程中，稿件从录用到出版要经历录用定稿、排版定稿、整期汇编定稿等阶 段。录用定稿指内容已经确定，且通过同行评议、主编终审同意刊用的稿件。排版定稿指录用定稿按照期 刊特定版式（包括网络呈现版式）排版后的稿件，可暂不确定出版年、卷、期和页码。整期汇编定稿指出 版年、卷、期、页码均已确定的印刷或数字出版的整期汇编稿件。录用定稿网络首发稿件内容必须符合《出 版管理条例》和《期刊出版管理规定》的有关规定；学术研究成果具有创新性、科学性和先进性，符合编 辑部对刊文的录用要求，不存在学术不端行为及其他侵权行为；稿件内容应基本符合国家有关书刊编辑、 出版的技术标准，正确使用和统一规范语言文字、符号、数字、外文字母、法定计量单位及地图标注等。 为确保录用定稿网络首发的严肃性，录用定稿一经发布，不得修改论文题目、作者、机构名称和学术内容， 只可基于编辑规范进行少量文字的修改。 出版确认：纸质期刊编辑部通过与《中国学术期刊（光盘版）》电子杂志社有限公司签约，在 《中国 学术期刊（网络版）》出版传播平台上创办与纸质期刊内容一致的网络版，以单篇或整期出版形式，在印刷 出版之前刊发论文的录用定稿、排版定稿、整期汇编定稿。因为 《中国学术期刊（网络版）》是国家新闻出 版广电总局批准的网络连续型出版物（ISSN 2096-4188 ，CN 11-6037/Z ），所以签约期刊的网络版上网络首 发论文视为正式出版。 网络首发时间：2018-03-16 11:08:40 网络首发地址：/kcms/detail/11.1809.S0917.006.html 玉米种子萌发相关性状的全基因组关联分析 1,** 1,** 1 2 1,* 田润苗 张雪海 汤继华 白光红 付志远 1 河南农业大学农学院，河南郑州 450002; 2 新疆农业大学，新疆乌鲁木齐830052 摘 要: 种子萌发是出苗的前提，对玉米产量影响重大。为了解玉米种子萌发相关性状的遗传机制，本研究对476 份玉米自 交系种子萌发相关的6 个性状进行调查，结合125 万(1.25M) SNP 标记，利用3 种统计模型(Q, K, Q+K)进行全基因关联分析 (GWAS) 。结果表明K 模型能够较好地评价吸胀前重量、吸胀前体积、吸胀后重量、吸胀后体积和吸胀体积5 个性状; Q+K 模型能更好地评价吸胀重量性状。基于这6 个性状的最优模型的GWAS 结果，共检测到 15 个种子萌发相关性状的显著SNP， 15 个 SNP 对应 6 个 QTL，集中分布在玉米第3、第 6、第7 和第 10 染色体上，QTL 内单个SNP 能解释的表型变异为 5.09%~7.85% 。其中5 个QTL 可在多个生物学重复中被检测到。以最显著SNP 所在基因或附近基因作为QTL 的候选基因， 共筛选到6 个最可能的候选基因。GRMZM2G148411 是吸胀后重量、吸胀重量和吸胀体积3 个性状共同鉴定到的QTL 候选 基因，根据基