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- 2019-01-06 发布于福建
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基因组学课件8.比老较基因组学
比较基因组学 ;比较基因组学的产生;果蝇基因组;比较基因组学定义;比较基因组学的应用;比较基因组学与进化;比较基因组学与进化;比较基因组学的具体应用方法和策略;
基因组成的相似性
基因共线性synteny:基因排列顺序的一致性
宏观共线性:遗传连锁图上锚定标记排列次序的一致性
微观共线性:物理图上基因序列的一致排列
进化距离非常近的物种间保持很好的微观共线性
在进化过程中,基因共线性被各种因素所破坏,进化距离越远的物种之间基因共线性越差,
两个物种之间的共线性程度可以作为衡量它们之间进化距离的尺度
;高度保守和高度变异
X染色体极为保守,人类和猫的X染色体具有纵贯全条的共线性
在保守性较低的区段,基因进化速率快于整个基因组的平均进化速率
它们在种间基因组中很少表现共线性,甚至在同一物种的不同生态型之间这些区段也会发生较大变异
当用基因共线性程度估算物种分化年代时,应当注意避免高度保守和高度变异的区段
;Evaluation only.
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在基因组较小的模式植物中,分离被精确定位在大基因组中的基
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