生物大发分子相互作用.pptVIP

生物大分子相互作用;EGFR-ERK/MAPK信号通路核心蛋白互作网络;BAKER M. (2012). Proteomics: The interaction map. Nature, 484, 271-5.;蛋白与蛋白相互作用;通过神经递质乙酰胆碱调节心肌收缩; 我们体内有些肽是细胞间的化学信号，控制着情绪、行为、压力应答、血压、消化和癌症发展。它们一般与细胞膜上的受体蛋白相互作用，例如G蛋白偶联受体GPCR。GPCR负责将信息传达到细胞内的G蛋白，从而诱导产生特定的细胞反应。用药物激活这类GPCR可以改善相关疾病的治疗，不幸的是这类药物的研发特别困难，其中有部分原因就是缺少结合状态或激活状态的结构信息。;蛋白质间的相互作用力;DNA与蛋白质相互作用;组蛋白与非组蛋白 ;;非组蛋白的调节功能 ;转录水平的调控 顺式作用元件和反式作用因子： (1) 核心启动子成分 ， 如 TATA 框 ； (2) 上游启动子分 ，如 CAAT框 ,GC框 ; (3) 远上游顺序 ：如增强子 ，减弱子 、 静 息 子 ,酵 母 的 UAS （ upstreamactivator sequences）等。 (4) 特殊细胞中的启动子成分 ：如淋巴 细胞中的 Oct (octamer）和κB。 ; ; 反式作用因子可以分为3类； (1)??? 通用反式作用因子，，主要识别启动子的核 心启动成分，如TBP； （2）特殊组织与细胞中的反式作用因子，如淋巴细 胞中的Oct-2； （3）和反应性元件（response elenents）相结合的反 式作用因子。 如HSE（热休克反应元件，heat shock response element）， GRE（糖皮质激素反应元件glucocorticoid response element）； MRE（金属反应元件，metal response element）； TRE（肿瘤诱导剂反应元件，tumorgenic agent response element);;(一) 蛋白质直接和DNA结合 1.??螺旋转角螺旋（Helix-turn-helix, HTH）： 如LacO的R蛋白，λ的CI，Cro蛋白，涉及酵母交配型的a1和a2蛋白。真核生物中的Oct-1和Oct-2； 2.锌指结构（zinc fimger） 单个的锌指保守序列是：Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5- Leu-X2-His-X2-His Ⅰ型: 2Cys/2His : TF IIIA, SP1 Ⅱ型: 2cys/2cys : GAL4 ;3. 亮氨酸拉链（Leucine ziipper） 同二聚体（honwdimers） 异二聚体（hefercdimers） C-Jun,C-Fos,Myc , 4. 螺旋一环一螺旋（HLH） 在HLH中带有碱性区的肽链称为 碱性HLH（bHLH，protein）。 bHLH又分为两类。 A类是可以广泛表达的蛋白，包括哺乳动物的E12/E47（可和免疫球蛋基因增强子中的元件结合）和果蝇da（daughterless,性别控制的总开关基因）的产物； B类是组织特异性表达的蛋白，包括哺乳动物的MyoD(肌浆蛋白（myogen）基因的转录因子 果蝇的AC-S（achaete-scute 无刚毛基因的产物）;; 5．同源异形结构域（Homeodomains，HD） 是一种编码60aa的序列，长180bp，它存在于很多控制果蝇早期发育基因中，在高等生物中也发现了相关基序。 HD的C-端区域和原核阻遏蛋白的HTH同源，但也有几点不同: （1）HD的C端由3个α-螺旋构成，螺旋3结合于大沟，长17aa；而阻遏蛋白由5个α-螺旋构成，螺旋3长仅9个 aa； （2）原核的HTH的以二聚体形式与DNA结合，靶序列是回文结构，而HD是以单体形式与DNA结合，靶序列不是回文结构； （3）HD N-端的臂位于小沟，而HTH螺旋1的末端与DNA的背面接触。 ;;（二）蛋白质和配基的结合 甾类受体蛋白一般都具有3个不同的功能区： （1）N-端区是激活转录所需的区域，不 同受体之间此区的同一性仅小于15%； （2）DNA结合及转录活化区，同一性较高为94-42