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应用说明1 PCR仪
PCR仪:
关键的热学概念和变温速率
°
我们经常会在P C R 仪资料和网 温度,C
站上看到关键的热循环参数,但
却很少解释这些数字是如何被 100
推导出的或如何使用。变温速 模块温度曲线
(全部6个分区)
率(ra mp rat e) 、热过冲(t he rma l 90 平均变温速率
overshoot)及其他热学概念是PCR 温度范围
性能的关键,本文将使用A pplied 80
最大变温速率
Biosystems™ PCR仪系统作为标 温度范围
准,对这些概念进行深入解释。 70
此外,还对变温速率进行了测
样本温度曲线
试,并与公布的参数进行比较。 60
(全部6个分区)
变温速率: 时间
最大值vs.平均值,模块vs.样本 图1. 在ProFlex 96孔PCR系统升温过程中,所有六个分区的真实的模块和样本温度曲线。虚
线表示最大变温速率和平均变温速率下的温度范围。
温度循环是所有P C R 反应的基
础,仪器的 “变温”速率将决定
P C R 运行的整体速度。正因如 高,表示可以在更短的时间内达 展示最高的变温速率说明运行速
此,PC R仪制造商会公布 “变温 到特定的温度范围。术语 “升温 度更快。但是,这样的检测方式
速率”,以显示温度随时间的变 速率( u p ra m p) ”和 “降温速率 测得的变温速率往往高于其真实
化速度。变温速率一般以º C/ 秒 (down ramp) ”分别表示加热或冷 值。
表示。在温度与时间曲线中观察 却时的变温速率。毫无疑问,变
此概念,变温速率以曲线斜率表 温模块越快,PC R运行也越快,
示。曲线越陡峭说明变温速率越 因此很多PC R仪制造商试图通过
PCR仪通过加热并冷却金属模块,完成PCR反应的各 Applied Biosystems仪器采用专利算法,根据加样体
个步骤,比如变性,退火和延伸。最常公布的参数是 积计算PCR样本的温度。这使得我们能够公布更准确
最大模块变温速率(maximum block ramp rate) ,亦 的样本变温速率。我们还公布了模块变温速率,可以
称为模块变温速率峰值。最大模块变温速率表示可达 与其他制造商的仪器进行更直接的比较。
到的最高模块性能。在PCR运行过程中,上述最大性
能只在极短的时间内可以达到。PCR仪制造商还会公 概述:样本温度控制
布平均模块变温速率(average block ramp rates) , PCR仪达到并测量温度的方法取决于制造商。PCR仪
表示在较长的变温范围内温度变化的速率,提供更具 通常仅根据模块温度进行温度编程,不考虑液体样本
代表性的仪器性能和速度评估(图1) 。 的温度。
但仅仅是模块变温速率较快,并不意味着PCR反应的 但仅仅是模块达到了目标温度或 “设置点”,并
液体(样本) 的变温速率也同样迅速。PCR仪的模块热量 不意味着样本也达到了同样的设置点。A p p l i e d
传递至样本还需要时间
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