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基因组genome 基因的概念 基因（gene）：是遗传的基本单位，编码RNA或多肽链的核酸片段。 第一节 基因组是一套完整单倍体 的遗传物质的总和 基因组（genome)：细胞或生物体所含的一套完整的单倍体遗传物质。 核基因组 线粒体基因组 一、基因组储存了生物体整套的遗传信息 二、不同生物基因组蕴含的遗传信息量有 巨大的差别 C值：单倍体基因组的全部DNA量 人：109； 肺鱼：1011 三、不同生物基因组的结构和组织形式也 不同 病毒 原核 真核 简单 完善 精细 第二节 病毒基因组 病毒基因组结构和功能的特点 1. 不同病毒基因组大小相差较大 2.不同病毒的基因组核酸本质不同 每种病毒只含有一种核酸：DNA病毒 RNA病毒 3.基因组编码序列大于90% 4.单拷贝基因组（逆转录病毒基因组有2个拷贝） 5.基因有连续和间断之分： 病毒基因结构特征往往是与其宿主细胞的基因结构相类似。 6.相关基因丛集 7.基因重叠 基因重叠 同一段核酸能够编码2种或者两种以上蛋白质。 基因重叠现象还见于线粒体DNA和质粒DNA。 基因重叠 病毒基因组核酸的主要类型 双链DNA：SV40病毒 单链正股DNA：M13噬菌体 双链RNA：T4噬菌体 单链负股RNA： 单链正股RNA：逆转录病毒 （＋）股：序列与mRNA相同 （－）股：序列与mRNA序列互补 SV40 病毒基因组 双链环状DNA： 长5243bp 早期转录基因：编码T抗原、t抗原(选择剪接alternative splicing) 晚期转录基因：VP1 (45kD) VP2 (42kD)  VP3 (30kD) VP2\VP3 转录后剪切成 两种 VP1 重叠基因 T、t抗原的选择性剪接 逆转录病毒 RNA病毒。含编码依赖RNA的DNA聚合酶（逆转录酶）基因。 反转录病毒的基本结构及功能 2条完全相同的正股RNA（双拷贝） 3个结构基因(5’-gag--pol--env--3’) : pol---反转录酶 env---病毒外壳蛋白 gag--- 核心蛋白 长末端重复序列（long terminal repeats, LTR） HIV 逆转录病毒的一种，具有逆转录病毒的一般特征。 至少有6个调控基因：tat,rev,vif,vpu/vpx和vpr。 第三节 原核生物基因组比较简单 原核生物基因组的结构和功能特点 1.基因组相对较小，呈双链环状DNA分子，无染色体结构，具有单个复制起始点。 Ecoli 基因组 4.6×106bp。 4288个开放阅读框。 2584个操纵子。 基因平均长度951bp。 基因平均间距118bp。 2.具有操纵子（operon）结构： 几个功能相关的基因串连在一起，由一个启动子控制，构成一个转录单位，转录产生一个多顺反子（基因）mRNA。 3.其它结构特点： －－基因密度高，多为单拷贝；编码 rRNA的 基因往往是多拷贝 －－重复序列很少 －－有编码同工酶的同基因(分枝酸别构 酶、乙酰乳酸合酶） －－不同原核生物GC含量变化很大 （25%-75%）不等 4.非编码区主要是一些调控序列 复制起始区OriC、TerC、转录启动区、终止区等 Trp operator： 3’端40bp的GC区，紧跟一个AT区 5.细菌基因组中存在着可移动的DNA序  列，产生转座现象 转座因子的分类： 1.插入序列(insertion sequence, IS) ，是一类较小的转位因子，2K以内，除带有与转座作用有关的基因外不带任何基因 。 2.转座子(transposon,Tn)，2K-20K，包含蛋白编码基因的可移动的DNA序列。 3.Mu噬菌体：温和噬菌体，整合位置不确定 插入序列 转座子（Tn） 复合型Tn： TnA： Mu噬菌体 转座因子的几个效应 转座因子不是本身移动，而是复制一个新拷贝移动 转座后，靶序列会倍增，位于转座因子的两侧，形成同向重复序列 转座过程中形成共合体 转座后引起染色体畸变 转座因子可发生切离（excision） 转座引起插入突变 转座使