人腺体激肽释放酶2同源模建及与底物分子对接研究-生物学、生理学专分业毕业论文.pdf.docxVIP

’，，一嗲，坶≯．参兰州大学硕士研究生论文 ’，，一嗲，坶≯．参 兰州大学硕士研究生论文 杨丹 摘 要 人腺体激肽释放酶2(hK2)由于其在前列腺癌检测治疗等方面的潜在临床应用 价值，近年来受到了广泛研究。但由于hK2的自水解作用，获得其晶体结构非常困 难，这使得对其结构功能间的关系认识较少。为了探讨hK2的结构活性关系，为后 续的以hK2为靶标的药物设计等研究提供理论基础。本课题以其家族同源性高的成 员为模板，利用同源模建的方法构建出hK2的模型，随后用分子动力学计算对模型 进行进一步优化。并用模型优化后的模型与其底物进行了分子对接实验，探讨了其 与底物的作用方式。 经验证，通过同源模建所构建的模型较为可靠。该模型与其同家族的成员间极为 相似，主要的区别存在于表面的loop区，特别是kallikrein loop，kallikrein loop的结 构影响了底物与hK2的接近。其催化三联体高度保守，侧链走向与同家族成员一致。 此外，保守的5对二硫键稳定了酶的整体结构。通过对接实验，我们发现其S1结合 口袋的组成与hKl、hK4、hK5和hK6有一定相似性，结合口袋中的氨基酸与底物 P1位点Arg胍基间形成广泛的氢键联系，为底物专一性提供了结构基础。 通过本课题的研究，使得对hK2结构功能间的关系，与底物识别的方式有了一 定认识，这些信息将对随后的研究提供支持和指导。 关键词：hK