华南野生蓖麻遗传多样性分析与核心种质构建-作物遗传育种专业论文.docxVIP

/ ?f$1 ?f$1 1 Il l IP II[1 ll l l I[J， !，Y1 804065 I CIaSsined lndex： $326 Security Classification： U．D．C．： 25 Security Period： Dissertation for the Master’S Degree GENNTIC DIVERSITY AND C ORE COLLECTION OF WILD CASTOR．OIL PLANT IN SOUTH CHINA Candidate： Zhang Dan Supervisor： Prof．Yin Xuegui Subject： Agriculture Speciality： Crop Genetics and Breeding Research field： Castor-oil Plant Germplasm Diagnostics Universitv： Guangdong Ocean University Submission date： April 20，2010 广东海洋大学 广东海洋大学 学位论文原创性声明 本人郑重声明：所呈交的论文是本人在导师的指导下独立进行研究所取得的研究 成果。除了文中特别加以标注引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经 发表或撰写的成果作品。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明 确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。 作者签名： 弓长舟 2010年4月20日 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并 向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授 权广东海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以 采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。 本学位论文属于1、保密口，在 年解密后适用本授权书。 2、不保密团。 (请在以上相应方框内打“4) 作者签名： 2010年4月20日 导师签名： 2010年4月20日 华南野生蓖麻遗传多样性研究 华南野生蓖麻遗传多样性研究 与核心种质构建 摘要 本文以258份华南野生蓖麻材料为基础，开展了基于表型标准化数据、SRAP分 子标记数据和SSR分子标记数据的遗传多样性研究，初步构建了华南野生蓖麻核心 种质。主要结果如下： 一、利用13个性状的标准化数据、29对SRAP引物数据和30对SSR引物数据 分别对194份、258份、258份华南野生蓖麻材料进行了遗传多样性分析。 1、三种聚类结果的平均遗传距离分别为为7．144、9．249和6．519，平均Shannon 指数分别为7．486、0．428和0．287，表明SRAP数据能更有效地反应群体的遗传多样 性，基因型值数据能更全面地反映群体的变异度。 2、SRAP标记检测到的平均等位基因数与SSR标记几乎相等(分别为1．996和2)， 但平均有效基因基因数高于SSR标记(分别为1．367和1．182)，表明SRAP标记检测 到的等位基因在群体中分布更均匀。SRAP标记的平均Nei’S基因多样性值(0．263) 和平均Shannon指数(0．428)高于SSR(0．287和O．153)，SRAP标记比SSR标记更能 反映出群体的遗传分化度和遗传变异度。 3、三种聚类结果均表明，材料的亲缘关系与地理远近没有直接关系，但小范围 内，材料亲缘关系往往较近。同一地区的材料在小组中成组趋势明显。 4、广东的材料遗传多样性最丰富，广西次之，海南最低。 二、采用混合线性模型，用最小范数二阶无偏估算法(Minimum Norm Quadratic Unbiased Estimation，MINQUE)估计各项随机效应方差，用调整无偏预测法(Adjusted Unbiased Prediction，AUP)估算数量性状的基因型值，用UPGMA法聚类后，分别 以5％、10％、15％、20％、25％、30％的抽样比例，以最小距离逐步取样法(LDSS) 抽样，构建了6个初级核心子集，经代表性评价后从中确定初选核心种质；在此基础 上，以6种压缩方式(基因型值、SRAP、SSR、基因型值+SRAP、基因型值+SSR、 基因型值+SRAP+SSR)和3种取样策略(最小距离逐步聚类随机取样(LDSRS)、最 小距离逐步聚类优先取样(LDSPS)和最小距离逐步聚类偏离度取样(LDSDS))构 建备选核心子集，根据对备选核心子集的代表性评价结果建立备选核心种质和核心种 质。 1、抽样比例为25％的初级核心子集代表性最好，宜作为初选核心种质。 2、初选核心种质的平均Shannon(I)指数达到原群体