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第5章版蛋白质的三维结构
9.3、蛋白质的折叠可能是通过中间体的累进稳定性(Progressive stabilization of intermediates)而非随机组合 第9节 蛋白质的变性与折叠 Consider a small protein with 100 residues. If each residue can assume three different conformations, the total number of structures would be 3100, which is equal to 5 × 1047. If it takes 10-13 s to convert one structure into another, the total search time would be 5 × 1047 × 10-13 s, which is equal to 5 × 1034 s, or 1.6 × 1027 years. 第9节 蛋白质的变性与折叠 1040 of keystrokes to about 2800 the power of cumulative selection 9.4、分子伴侣(Chaperone) 伸展或部分折叠的蛋白质在高浓度时倾向于聚集,在体内蛋白质能在很稠的介质中高效发生的原因是因为分子伴侣的参与。 分子伴侣包括大量不同的蛋白质家族,这些蛋白质的功能包括帮助蛋白质的折叠和装配,稳定去折叠的蛋白质,对蛋白质去折叠以便转运过膜或进入蛋白降解途径等。 第9节 蛋白质的变性与折叠 分子伴侣的特性 分子伴侣通常与去折叠的或部分折叠的蛋白质相互作用。 他们可以促进蛋白质正确折叠或稳定非天然蛋白构象。 它们不与天然蛋白相互作用,也不会成为折叠后蛋白结构的一个组成部分。 分子伴侣对底物的特异性不同。 分子伴侣协助蛋白质折叠的过程中需要与ATP的水解偶联。 在细胞胁迫(cell stress)的情况下,分子伴侣的表达通常会增加。 第9节 蛋白质的变性与折叠 Families Of Molecular Chaperones 第9节 蛋白质的变性与折叠 Small heat shock proteins (hsp25) [holders] protect against cellular stress prevent aggregation in the lens (cataract) Hsp60 system (cpn60, GroEL) ATPase [(un)folders] protein folding Hsp70 system (DnaK, BiP) ATPase [(un)folders] stabilization of extended chains membrane translocation regulation of the heat shock response 第9节 蛋白质的变性与折叠 Hsp90 [holder] binding and stabilization/regulation of steroid receptors, protein kinases Buffer for genetic variation? Hsp100 (Clp) ATPase [unfolder] thermotolerance, proteolysis, resolubilization of aggregates Calnexin, calreticulin glycoprotein maturation in the ER quality control Folding catalysts: PDI, PPI [folders] Prosequences: alpha-lytic protease, subtilisin (intramolecular chaperones) [folders] 第9节 蛋白质的变性与折叠 本章涉及到的基本概念有哪些? 真核细胞中HSP70蛋白的作用有哪些? 问题 一个学生根据试验得出的下面数据而提出一种说法:即很多含有-S-S-键的蛋白质在空间结构形成的过程中,-S-S-键的形成是非随机的。它将一系列含有二硫键的蛋白质在8 mol/L尿素(作为变性剂)存在下,用β-巯基乙醇处理以还原-S-S-键。这些试剂用适当的方法逐渐除去,以便使蛋白因二硫键的再形成而重新折叠。所得3种蛋白质经变性和再折叠后生物学活性的恢复数据如下: 蛋白质 -S-S-键数目 生物学活性的恢复(理论计算) 生物学活性的恢复(试验数据) 核糖核酸酶 4 0.95% 100% 溶菌酶 4 0.95% 80% 胰岛素 3 6.70% 7% (1)对于含4个-S-S-键的蛋白
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