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金黄色葡萄球菌artr的功能研究及ranⅲ结合蛋白的鉴定-微生物学专业论文
优秀毕业论文
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中国科学技术大学学位论文原创性声明本人声明所呈交的学位论文,是本人在导师指导下进行研究工作所取得的成
中国科学技术大学学位论文原创性声明
本人声明所呈交的学位论文,是本人在导师指导下进行研究工作所取得的成 果。除己特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含任何他人已经发表或撰写 过的研究成果。与我一同工作的同志对本研究所做的贡献均己在论文中作了明确 的说明。
作者签名:主兰丝 签字日期: 历,f‘·/,
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保密的学位论文在解密后也遵守此规定。
\么开 口保密( 年)
作者签名:盏也 导师签
签字El期:如/歹.万./ 签字日期厂2望叁笸;Z
万方数据
摘要摘要
摘要
摘要
金黄色葡萄球菌是典型的革兰氏阳性条件致病菌,在环境中分布广泛。近年 来,金黄色葡萄球菌己成为主要的临床感染菌,医院内每年都会有数以百万的金 黄色葡萄球菌感染发生。金黄色葡萄球菌感染能够引发的症状有食物中毒、溃疡、 心内膜炎、骨髓炎、肺炎等,甚至引起败血性休克而导致死亡。金黄色葡萄球菌 之所以能引起如此多的病症,是因为它能分泌多种致病因子,其中0【溶血素是非 常重要的毒素之一。在感染过程中,这些毒性因子受到了广泛而精细的调控,从 而帮助细菌响应和适应各种复杂的环境。这些调控因子包括二元信号系统、转录 调控蛋白和非编码RNA等。
我们在前期研究LuxS/AI.2信号系统时,发现了一个与luxS反向重复的 sRNA。Northern blot和RACE分析证实,这个sRNA全长为345nt,并将其命名 为ArtR。序列分析和RT-PCR等实验表明,ArtR是金黄色葡萄球菌中所特有的 一种sRNA,它的表达受到Agr群体感应系统的抑制。但是这种抑制效应不是通 过Agr群体感应系统常用的RNAIII来实现,而是直接通过AgrA蛋白与ArtR的
启动子相互作用来实现。基因敲除实验发现,ArtR的缺失影响了金黄色葡萄球
菌0【溶血素的水平。而凝胶阻滞分析实验证明,ArtR并不能直接结合0c溶血素 的mRNA。于是我们寻找了旺溶血素相关的转录因子,发现ArtR突变株中0c溶 血素的抑制因子SarT的水平有所升高。通过凝胶阻滞分析和RNA酶解等实验 我们证实ArtR通过与sarT 5UTR上的一段区域与相互作用,促进了RNase III 对sarT mRNA的降解。这项研究鉴定了金黄色葡萄球菌属中一个新的毒性相关
的sRNA,并且阐明它是通过与转录因子mRNA相互作用来实现其调控过程的。
sRNA调控不仅局限于sRNA与靶RNA的相互作用,可能有很多蛋白质参 与其中。但是由于技术的限制,对金黄色葡萄球菌中sRNA相关的蛋白质知之甚 少。我们通过前期的研究工作成功建立了利用tRNA融合RNA适配体(简称 tRSA)进行sRNA蛋白质pull.down的实验体系,选取了金黄色葡萄球菌中重
要的sRNA一一RN趾II,对其结合蛋白进行钓取。实验发现tRSA标记的RNA能
够较好被链霉亲和素磁珠捕获,用这个体系成功钓取了81个能够结合RNAIII的 候选蛋白质。我们进一步通过蛋白质表达、凝胶阻滞分析验证了这些候选蛋白与 RNAIII的结合能力。选取的9个蛋白质中,RNase III对RNAIII具有降解活性, 7个蛋白(CshA、RNase J2、Era、Hu、WaIR、Pyk、FtsZ)可以结合RNAIII,
PikA没有检测出结合能力。同时选取了两个pull-down未鉴定出的,但属于RNA
万方数据
摘要降解体的蛋白,发现它们并不能够直接结合
摘要
降解体的蛋白,发现它们并不能够直接结合RNAIII。该实验表明金黄色葡萄球 菌中可能有很多蛋白质结合RNAIII,并有可能参与它的调控过程;tRSA的体系 能够很好的运用于金黄色葡萄球菌sRNA结合蛋白的pull-down实验,并且成功 鉴定出部分RNAIII的结合蛋白质。深入研究这些蛋白质对于sRNA调控以及金 黄色葡萄球菌致病性调控的作用,能够深化我们对细菌sRNA调控机制和复杂网 络的认识。
关键词: 金黄色葡萄球菌,非编码RNA,ArtR,0【溶血素,SarT,RNA结合
蛋白,tRSA,pull·down
Ⅱ
万方数据
AbstractABSTRACT
Abstract
ABSTRACT
Staphyl
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