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鮸鱼rif1亚家族成员基因结构及进化分析-海洋生物学专业论文
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论文作者签名:白杨
日期: _l l}年6月≥日
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粼一躲铅畅 雌名:沁酽蛩
日期:训年6月2日 日期:7。乡年钐月)日
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《:中国博士学位论文全文数据库》、
《:中国博士学位论文全文数据库》、 l:中国优秀硕士学位论文全文数据 库》和《:万方数据电子出版社》投稿声明
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论文级别:留硕士口博士
学位论文作者签名:铸畅 指导教师签名:
日期: ■f 6年6月1日 日期: V l 年多月Ij7日
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作者联系地址(邮编): 作者联系电话:
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摘要摘要
摘要
摘要
干扰素调节因子是转录因子的成员,最早被定义具有调节干扰素的表达的作用。
干扰素调节因子家族成员均具有调节干扰素以及干扰素相关基因(例如:№,ISGl5 和V远.1)的功能。作为重要的调节因子,干扰素调节因子在抗病毒、免疫应答、细 胞生长调节以及细胞凋亡中均具有重要的作用。哺乳动物的干扰素调节因子家族成员 已经被大量的研究,但是在低等动物中,干扰素调节因子成员却很少被研究。干扰素 调节因子在一些鱼类中被深入研究过,本文中对觥鱼干扰素调节因子进行研究。兢鱼 作为石首鱼科中的代表物种,主要分布在日本西部海域到中国东海。兢鱼是具有重要 经济价值的鱼类,并被大范围人工养殖。干扰素调节因子家族成员已被证实在哺乳动 物中是非常重要的免疫调节因子,鱼类中的干扰素调节因子也应该进行更深入地研究 其在鱼类免疫系统中的功能,进而更加深入地了解鱼类免疫系统。
干扰素调节因子1亚家族中的干扰素调节因子1和干扰素调节因子2在对抗病毒 中有非常重要作用。IRFll基因是IRF家族中的新成员,发现与IRFl和IRF2基因的 遗传距离很近,被定义为IRFl亚家族的新成员,但是IRFll基因的结构与特性几乎 没有被研究与报道过。在本研究中,我们从兢鱼基因组中获得IRFl、IRF2和IRFll 基因全长,并在生物信息学方面进行综合地分析,包括基因结构、蛋白质结构域、基 因线性、分子进化模式和表达特性。同时,我们也从基因组复制的角度分析了各个物 种中IRFl亚家族成员个数,进一步了解IRFl亚家族的进化历程。
通过对鱿鱼IRFl的研究发现,娩鱼IRFl全长为900bp,其N端编码DNA识别区 域DBD结构,并在D叻结构域中有六个保守的色氨酸。通过与其他物种的序列对比, 发现娩鱼IRFl序列与其他物种的IRFl序列的D肋结构域非常保守,序列相似性也相 对很高。航鱼IRFl的基因结构中有9个外显子和8个内含子,与其他近缘物种IRFl 基因的基因结构相对保守。基因线性的研究表明,娩鱼IRFl同其他鱼类(除斑马鱼) 均具有很高的同线性。研究发现兢鱼IRFl在肝脏、血和肠中大量表达,说明肝脏、 血和肠是娩鱼IRFl重要的产生场所。感染实验表明,觥鱼IRFl在肝脏和脾脏是高表 达的,而在肾脏中的表达受到抑制。鱼类和哺乳类IRFl基因的进化模式分析表明, 鱼类经历着纯化选择,而哺乳类经历着正选择作用,表明鱼类和哺乳类IRFl基因经 历了不同的进化模式。
对娩鱼IRF2研究发现,兢鱼IRF2全长为957bp,其N端具有非常保守
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