Skyline处理分组研究数据.PDFVIP

Skyline 处理分组研究数据 第 1 部分：用于方法调整的免标记区分法 靶向蛋白质组学作为一个检测方法已受到越来越广泛的关注，其主要优势表现在跨生物组间蛋白 质和多肽表达的差异性分析。Skyline 最初由美国国家癌症研究所 (NCI) 癌症临床蛋白质组学技 术评估 (CPTAC) 项目资助建立，因为它致力于显示靶向蛋白质组学可以有效地应用于疾病生物信 号的检测和可靠性验证。 在本教程中，您将使用 Skyline 用于分析一组SRM数据。这组数据来源于一个条件控制的盐敏感 型老鼠心力衰竭实验。这个实验通过检测一系列文献中报道的与心力衰竭有关的潜在蛋白，来分 析疾病组和健康组中血浆蛋白表达的差异。 这个实验监控了49 个蛋白质中的 137 个肽段在42 次 LC-MS/MS 测试过程中的表达状况。当您熟 悉了本教程讲述的数据处理和视图技术后，您将能够更轻松地管理和处理更大型数据 （更多的实 验组，更多的目标蛋白）。而如若没有本教程，您很可能会在处理更小数据集时仍感到茫然失措。 本教程由以下部分组成：  开始  方法优化后的差异分析  无参考标准下多平行实验组数据处理的设置  预定的 SRM 和峰截短  开始多平行实验组数据处理  全球标准化标准  平行实验组数据处理（续）