第五章 数量性的分子标记.pptVIP

Asominori/IR24置换系群体染色体置换图谱 应用代换系重叠群系统地对某数量性状进行QTL的精细定位: 必须进行代换系鉴定试验 即将所有代换系进行多年、多点重复试验，以受体亲本为对照，鉴定出目标性状均值与受体亲本差异显著，因而代换片段上应带有目标性状QTL的代换系，简称为目标代换系。 2)目标代换系QTL分析 与单QTL精细分析方法相同。 除了将各个目标代换系分别与受体亲本进行杂交之外，也可以在不同目标代换系之间进行杂交。 不同目标代换系之间的杂交： 1）进一步缩小QTL位置的区间 (1)两个相互重叠的代换系杂交→后代性状不分离→QTL相同，位于它们的重叠区内。 (2)两个相互重叠的代换系杂交→后代性状分离→QTL不同，位于它们的非重叠区内。 a b 两个相互重叠的代换系间杂交以进一步缩小QTL位置的区间 (a)两代换系所带的QTL相同且位于重叠区内，后代不出现性状分离。 (b)两代换系所带的QTL不同，分别位于各自特有的区域(即非重叠区)上，后代出现性状分离。 2)研究不同QTL间(或代换片段间)的相互作用(上位性效应)。 有的代换系在鉴定试验中与受体亲本间没有表现出显著的差异，但在代换系间杂交中却表现出效应，这说明它实际上含有QTL，只是该QTL在单独存在时没有效应(不存在主效应)，而必须与某个(些)别的QTL共同存在时才表现出表型效应(上位性效应)。 代换系重叠群的构建一般也是采用多代回交的办法，但必须借助于完整的分子标记图谱和标记辅助选择技术（参阅第六章）。 对于一个全长为1500 cM的基因组来说，假设要求每个代换片段长为10 cM，且相邻片段首尾相接，且没有重叠，则需建立150个代换系才能覆盖整个基因组。这只是一个理论下限，实际情况要复杂得多。要建立一套理想的代换系重叠群，在实践上还是有相当难度的。 谢 谢！ * 第五章 数量性状的分子标记 张晓军/严敏 电话E-mail：zhangxj@qau.edu.cn 生物楼N213，育种学教研室 作物中大多数重要的农艺性状和经济性状如产量、品质、生育期、抗逆性等都是数量性状。与质量性状不同，数量性状受多基因控制，遗传基础复杂，且易受环境影响，表现为连续变异，表现型与基因型之间没有明确的对应关系。因此，对数量性状的遗传研究十分困难。 数量性状的遗传 P1 P2 F1 F2 X 不遵循孟德尔定律，F2连续分布。 多基因控制。 基因效应小，但呈累加作用。 控制数量性状的基因在基因组中的位置称为数量性状基因座(QTL)。 传统的方法是用平均值和方差来反映数量性状的遗传特征，无法了解单个基因的位置和效应。 利用分子标记进行遗传连锁分析，可以检测出QTL的位置和效应，即QTL定位(QTL mapping)。 借助与QTL连锁的分子标记，就能够在育种中对有关的QTL的遗传动态进行跟踪，提高育种中对数量性状优良基因型连择的准确性和预见性。 QTL的精细定位与图位克隆。 第一节 数量性状基因的初级定位 QTL定位就是检测分子标记与QTL间的连锁关系，同时还可估计QTL的效应。 QTL定位研究常用的群体有F2、BC1、RI和DH。这些群体可称为初级群体(primary population)。 用初级群体进行的QTL定位的精度通常不会很高，因此只是初级定位。 一、QTL定位的基本原理和方法 QTL定位的原理: 其基本原理仍然是对个体进行分组，但这种分组是不完全的。 根据个体分组依据的不同，现有的QTL定位依方法可以分成两大类: 1)基于标记的分析法(marker-based analysis) 以标记基因型为依据进行分组 2)基于性状的分析法(trait-based analysis) 以数量性状表型为依据进行分组 （一）基于标记的分析法 原理: 如果某个标记与某个QTL连锁，则在杂交后代中，该标记与QTL之间就会发生—定程度的共分离，那么在该标记的不同基因型中，QTL的基因型频率分布(分离比例)将不同,因而在该标记的不同基因型之间，在数量性状的分布、均值和方差上都存在差异。 通过检验标记的不同基因型之间的差异来推知标记是否与QTL连锁。 DH群体中某QTL的基因型QQ和qq在连锁标记基因型MM和mm中的频率分布(分离比例)，r为标记与QTL间的重组率。仅当r＝0.5(亦即标记与QTL间没有连锁)时，QQ和qq在MM和mm中的频率分布才相同。 （2）基于性状的分析法 原理:利用极端类型个体分