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从而解得 所以原递推关系的解为 §2 近似算法 近似算法是求解组合优化问题的一类多项式时间算法,它们尽管不能确保对问题的每一个实例都可以求得最优解,但是可以保证求得的解的目标值与最优解的目标值相差不多。自20世纪60年代末格雷厄姆在研究排序问题时提出第一个近似算法以后,特别是70年代初库克首次证明了存在NP一完全问题以来,为各种各样的组合优化问题设计近似算法就一直是组合优化领域的一个重要研究方向。 主要包括三个方面: 设计近似比越来越小的近似算法; 设计运行时间越来越短的近似算法; 证明近似比的下界或者不可近似性。 已有的大量研究主要都集中在第一个方面,人们先后提出了对偶、半定规划、随机算法、平面划分和次模函数等技巧。第二方面的工作主要是针对存在多项式时间近似方案的NP一难问题,而第三方面的工作主要是利用20世纪90年代阿罗拉等人提出的概率可验证系统。这一方向中有很多问题有待解决。 所有已知的解决NP-难问题算法都有指数型运行时间。但是,如果我们要找一个“好”解而非最优解,有时候多项式算法是存在的。 给定一个最小化问题和一个近似算法,我们按照如下方法评价算法:首先给出最优解的一个下界,然后把算法的运行结果与这个下界进行比较。对于最大化问题,先给出一个上界然后把算法的运行结果与这个上界比较。 迄今为止,所有的NP完全问题都还没有多项式时间算法。 对于这类问题,通常可采取以下几种解题策略。 (1)只对问题的特殊实例求解 (2)用动态规划法或分支限界法求解 (3)用概率算法求解 (4)只求近似解 (5)用启发式方法求解 旅行售货员问题近似算法 问题描述:给定一个完全无向图G=(V,E),其每一边(u,v)∈E有一非负整数费用c(u,v)。要找出G的最小费用哈密顿回路。 旅行售货员问题的一些特殊性质: 比如,费用函数c往往具有三角不等式性质,即对任意的3个顶点u,v,w∈V,有:c(u,w)≤c(u,v)+c(v,w)。当图G中的顶点就是平面上的点,任意2顶点间的费用就是这2点间的欧氏距离时,费用函数c就具有三角不等式性质。 对于给定的无向图G,可以利用找图G的最小生成树的算法设计找近似最优的旅行售货员回路的算法。 void approxTSP (Graph g) { (1)选择g的任一顶点r; (2)用Prim算法找出带权图g的一棵以r为根的最小生成树T; (3)前序遍历树T得到的顶点表L; (4)将r加到表L的末尾,按表L中顶点次序组成回路H,作为计 算结果返回; } 当费用函数满足三角不等式时,算法找出的旅行售货员回路的费用不会超过最优旅行售货员回路费用的2倍。 (b)表示找到的最小生成树T; (c)表示对T作前序遍历的次序; (d)表示L产生的哈密顿回路H; (e)是G的一个最小费用旅行售货员回路。 §3 组合多面体 给定一个线性系统,判定其是否定义了一个整数多面体、是否为全对偶整数系统、是否为盒式对偶整数系统,这三个判定间题是整数规划的核心间题,也构成了组合多面体理论的基本内容;这是因为当一个整数规划实例是由一个整数多面体所定义的,那么它可以在多项式时间内求解(一般的整数规划是NP一难解的)。 罗瓦兹、施瓦维尔和埃德蒙兹在内的许多著名数学家都研究过组合多面体的结构刻画、计算复杂性等相关问题。另外,由于很多组合优化问题都可以非常容易地表示为整数规划问题,因而这些问题也是组合优化的重要研究课题。 比如,组合优化中的一大类问题都可以用超图中的装填问题和覆盖间题来描述;装填问题是求含有边数最多的装填,而覆盖问题是求一个顶点覆盖其中所有顶点的权值之和最小。已经知道装填问题和覆盖问题都是NP一难解的,因此除非P=NP,它们都不存在多项式时间的算法。这两个组合优化问题都可以通过组合多面体的理论和方法研究,特别是:有向图和无向图上的圈装填和覆盖对偶关系和有向图上的装填和反馈集覆盖对偶关系。 §4 生物分子网络 生物分子网络是系统生物学的基本出发点和主要研究对象,因为从系统的观点看,生命系统是通过基因之间、蛋白之间、代谢物之间以及基因、蛋白质、代谢物、环境与功能和表象之间的相互作用来运行的,正是这些相互作用确定了细胞、组织、器官和生物个体的动态行为。所以系统生物学的根本挑战在于建立完整的、细致的生物分子间联系的描述,并藉此在分子水平及系统的观点来探索生命机理,解释复杂生命现象。 最优化理论包括连续优化、组合优化和网络优化等运筹学方法和理论在生物分子网络的研究中都起到了重要作用。典型的研究内容和问题包括:基因调控网络和蛋白质相互作用网络的数学建模;从生物进化角度出发的生物分子网络进化模型和算法;从高通量生物实验数据出发的网络重构算法;着眼于功能预测与标注的基因蛋白功能联系网络的构建和分析,以及生物分子网络的功能模块探测、网
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