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一级结构决定蛋白质的三维结构
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苏州大学基础医学与生物科学学院教案
编号: 03
课程 生物化学(四) 授课人
授课日期 授课学时 4
章节
第4章 蛋白质的三维结构(教材第5章)
目的
要求
1、了解研究蛋白质构象的方法和稳定蛋白质三维结构的作用力。
2、掌握多肽主链折叠的空间限制内容。
3、掌握蛋白质二级结构的概念及各种类型的结构。
4、掌握蛋白质的超二级结构和结构域的概念及结构特点,结构域与三级结构或蛋白质的关系。
5、掌握球状蛋白质的三级结构。
6、掌握蛋白质的变复性。
7、掌握蛋白质的四级结构与亚基等概念。
授课
内容
第4章 蛋白质的三维结构(教材第5章)
一、研究蛋白质构象的方法(5′)
二、稳定蛋白质三维结构的作用力(10′)
三、多肽主链折叠的空间限制(15′)
肽基(peptide group)或肽单位(peptide unit)、肽平面或肽基平面、肽平面的构型、二面角。
四、蛋白质的二级结构(50′)
概念、二级结构的主要作用力、主要类型:a-螺旋、b-折叠、b-转角、无规卷曲
五、超二级结构和结构域(30′)
超二级结构、超二级结构类型、结构域(domain)、结构域与功能域、结构域的类型、结构域与三级结构或蛋白质的关系
六、球状蛋白质与三级结构(20′)
蛋白质的三级结构、球状蛋白质的分类、球状蛋白质三维结构特征
七、蛋白质的折叠和结构预测(20′)
蛋白质变性
一级结构决定蛋白质的三维结构
八、蛋白质的四级结构(10′)
有关四级结构与亚基的一些概念
四级缔合在结构和功能上的优越性
重点
难点
重点:蛋白质二级结构的概念及各种类型的结构特点;蛋白质的高级结构、蛋白质的变性。
难点:多肽主链折叠的空间限制,蛋白质高级结构的理解重点。
思考题
1、名词解释:蛋白质的二级结构、超二级结构、结构域、蛋白质的三级结构、蛋白质的四级结构、超二级结构、结构域、亚基
2、某一蛋白质的多肽链在一些区段为α螺旋构象,在另一些区段为β构象,该蛋白质的分子量为240000,多肽链外形的长度为5.06x10-5厘米,试计算:α螺旋体占分子的百分比?(假设β构象中重复单位为0.7nm,即0.35nm长/残基。氨基酸残基平均分子量以120为计)
3、测得一个蛋白质中色氨酸的残基占总量的0.29%,计算蛋白质的最低分子量。(色氨酸残基的分子量为186)
4、试计算油100个氨基酸残基组成的肽链的α.-螺旋的轴长长度。
5、一个大肠杆菌的细胞中含106个蛋白质分子,假设每个蛋白质分子平均分子量约为40000,并且所有的分子都处于α-螺旋构象,计算每个大肠杆菌细胞中的蛋白质多肽链的总长度。(假设氨基酸残基的平均分子量为118)
其它
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