黄瓜SRAP遗传加盟图构建及侧枝基因定位27.pdfVIP

中国科学C辑 生命科学 2004,34(6):510516 黄瓜SRAP遗传连锁图的构建及侧枝基因定位 ‘ 王 刚t潘俊松t李效尊 何欢乐 吴爱忠 蔡 润** (上海交通大学农业与生物学院，上海201101) 摘要 在由黄瓜的两个自交系S06与S52杂交产生的F2群体中，应用SRAP(sequence-related amplifiedpolymorphism)标记构建遗传连锁图谱，检测控制黄瓜侧枝数(lbn)和侧枝平均长度(lbl) 的数量性状座位(QTL).使用筛选出的64个多态性引物组合对F2群体进行分析，得到108个多态 性位点.经MAPMAKER/EXP3.0分析((LOD3.0)，获得由92个标记座位组成、覆盖7个连锁群 的遗传图谱，总长1164.2cM，标记平均间距12.6cM.应用QTLMapperl.6，各检测到4个控制lbn 和lbl的QTL，其中，对lbn贡献率最大的QTL位于第二连锁群的ME11SA4B-ME5EM5区间，其 S06基因型具有增效作用;对lbl贡献率最大的QTL位于第二连锁群的DClOD3-DCIEM14区间， 其S06基因型具有增效作用. 关键词 黄瓜 SRAP 连锁图 侧枝基因 数量性状座位 (QTL) 黄瓜(CucumissativusL.2n=2x=14)是重要的蔬 1997年，Serquen等人151利用重组近交系构建了含77 菜作物之一，在世界上的栽培面积仅次于番茄，位居 个RAPD标记和3个基因位点的黄瓜遗传图谱，分属 第二[Ill.黄瓜的经典遗传图谱是由100多个颜色、形 9个连锁群，覆盖约600cM;2003年，Fazio等人[61 态和抗病性等基因组成的6个连锁群[[21.虽然分子标 构建了包含131个标记、覆盖706cM、平均间距5.6 记早已用于黄瓜的遗传作图，但进展缓慢.1994年， cm 的遗传图谱.黄瓜有7对染色体，由于染色体小 Kennard等人[[31利用RFLP,RAPD，同工酶，形态和抗 且难以观察，加之黄瓜本身的细胞遗传学研究落后， 病性所产生的标记，构建了由58个位点组成的黄瓜 所以迄今黄瓜的分子标记连锁群与染色体的对应关 遗传图谱，分属 10个连锁群，覆盖的基因组总长度 系尚不清楚. 约为766cM，标记间平均距离约为13cM;1995年， 黄瓜是一种遗传背景十分狭窄的植物17-101，一般 Lee4[1利用RAPD在黄瓜的杂交F:群体中发展分子标 通用的分子标记如RAPD(randomamplifiedpoly- 记，获得具有28个RAPD标记的黄瓜分子连锁图谱; morphicDNAs)所能揭示的多态性十分有限，共显性 2004-07-28收稿，2004-08-23收修改稿 *上海市科委项目(批准号:033107019)和上海市农委项目(沪农科攻字((2003)第2-1-2号)资助 **联系人:E-mail:cairun@ 卞同等贡献 SCIENCEINCHINASer.CLifeSciences 万方数据 第6期 王 刚等:黄瓜SRAP遗传连锁图的构建及侧枝基因定位 的RFLP(restrictionfragmetnlengthpolymorphism)和 子，F1种植后自交获得F2.F:群体的200单株于2003 SSR(simple-sequencerepeat)标记的多态性也不高，而 年6月种植于上海交通大学农业与生物学院温室，各 且可利用的分子标记数目有限.因此，新标记技术的 单株使用统一配置的基质，装袋后定植，统一肥水管 应用对于更好地构建遗传图谱、定位控制黄瓜重要性 理，随机挑选其中的138株作为作图群体. 状的基因十分必要.Li等人[[11〕在2001年发展了一种 (2)侧枝性状的调查与统计:定植后50天调查 新型分子标记SRAP(sequence-relatedamplifiedpoly- 亲本和F:群体中各单株的侧枝数量、每单株侧枝平 morphism).该标记通过独特的引物设计对开放阅读 均长度以及侧枝长于5节的侧枝数量.