基于GC-TOF-MS的结直肠癌代谢组学差异分析-山东大学.PDF

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基于GC-TOF-MS的结直肠癌代谢组学差异分析-山东大学

 第54卷 第7期 山 东 大 学 学 报 (医 学 版) 2016年7月   Vol.54  No.7     JOURNALOFSHANDONGUNIVERSITY(HEALTHSCIENCES)      Jul.2016   文章编号:1671-7554(2016)07-0060-09   DOI:10.6040/j.issn.16717554.0.2016.013 基于GCTOFMS的结直肠癌代谢组学差异分析 于斐,刘少壮,仲明惟,黄鑫,焦杰,胡三元,于文滨 (山东大学齐鲁医院普外科,山东 济南250012) 摘要:目的 探讨结直肠癌(CRC)患者癌组织、癌旁黏膜及正常黏膜的代谢差异。方法 选取25例 CRC患者, 分别取癌组织、癌旁黏膜和正常黏膜各1份,采用气相色谱-飞行时间-质谱(GCTOFMS)分析平台对组织样本 进行代谢组学检测,3种组织间相互比较并采用主成分分析和正交偏最小二乘判别分析对数据建模,分析差异代 谢物并在KEGG数据库中映射,找出相关代谢通路。结果 与正常黏膜相比,癌组织中有47种差异代谢物(P< 0.05,q<0.05),其半乳糖代谢、磷酸戊糖途径、谷氨酸和谷氨酰胺代谢及谷氨酸、丙氨酸和天冬氨酸代谢明显改 变(P<0.05);癌旁黏膜中有3种差异代谢物(P<0.05,q<0.05),其半乳糖代谢明显改变(P<0.05)。癌组织与 癌旁黏膜相比,有34种差异代谢物(P<0.05,q<0.05),其半乳糖代谢、磷酸戊糖途径、谷氨酸和谷氨酰胺代谢及 谷氨酸、丙氨酸和天冬氨酸代谢明显改变(P<0.05)。结论 CRC癌组织中糖代谢和氨基酸代谢发生改变。 关键词:结直肠肿瘤;代谢组学;糖代谢;氨基酸代谢 中图分类号:R605   文献标志码:A MetabolomicsanalysisofcolorectalcancerbasedonGCTOFMS YUFei,LIUShaozhuang,ZHONGMingwei,HUANGXin,JIAOJie,HUSanyuan,YUWenbin (DepartmentofSurgery,QiluHospitalAffiliatedtoShandongUniversity,Jinan250012,Shandong,China) Abstract:Objective Toexplorethemetabolicdifferencesofcancertissues,adjacentmucosaandnormalmucosain patientswithcolorectalcancer(CRC).Methods Atotalof25CRCpatientswereselectedandthe3kindsoftissues weretakenfromeachpatient.Gaschromatographytimeofflightmassspectrometry(GCTOFMS)platformwasused formetabolomicsanalysis.Thetissueswerecomparedamongeachother,andprincipalcomponentsanalysis(PCA) andorthogonalpartialleastsquaresdiscriminantanalysis(OPLSDA)wereusedtoanalyzethedata.Differentialme tabolitesweremappedintheKEGGdatabasetosearchfortherelatedmetabolicpathways.Results Comparedwiththe normalmucosa,47metaboliteswerefounddifferent(P<0.05,q<0.05)incancertissues,andgalactosemetabolism, pentosephosphatepathway,glutamateandglutaminemetabolism,glutamate,alanineandaspartatemetabolismchanged signi

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