猪泛素C端水解酶L1基因的克隆与序列分析-学报编辑部-华南农业.PDF

第28 卷第 1 期 Vo l. 28 , No.1 华南农业大学学报 2007 年 1 月 Joumal of South China Agricultural University Jan. 2007 猪泛素 C 端水解酶L1 基因的克隆与序列分析 田兴国，李加琪，陈瑶生，高 萍，梅盈洁，凌 飞，罗永发 (华南农业大学动物科学学院，广东广州 510642) 摘要:从人泛素 C 端水解酶L1 (UCH_L1) 基因出发，在 dbEST 数据库中同源搜索，找到 1 条与人 UCH_Ll 基因编码 氨基酸同源性较高且在香猪背最长肌中表达的 EST(BM194679) .通过电子克隆和进一步RT-PCR 试验验证，获得 猪 UCH_L1 基因全长cDNA 序列，其全长 1 105 bp ，开放阅读框( ORF) 位于60 -728 句，编码 223 个氨基酸.同源、性 分析结果表明，与人、鼠 UCH_L1 基因 cDNA 编码区(CDS) 同源性分别为91. 2% 和 86.5% ，蛋白质序列同源性均为 96.6%. 对该基因编码蛋白的结构和功能预测显示含有2 个典型的疏水性区域，不含有信号肤，存在 1 个 UCH_11 ( pfamO 1088)保守结构域和多个磷酸化位点，属 UCH 11 蛋白家族，故将该基因命名为猪泛素 C 端水解酶L1 基因 (登录号 AY495532) 关键词:猪;泛素 C 端水解酶L1 (UCH_L1) 基因;电子延伸;基因序列分析 中图分类号:S813.1 文献标识码:A 文章编号: 1001-411X(2007)01-0100-05 Cloning and Sequence Analysis of Ubiquitin C-Terminal Hydrolase Ll Gene of Pig TIAN Xing-guo , LI Jia-qi , CHEN Yao-sheng , Gao Ping , MEI Ying-jie , LING Fei , LUO Yong-fa (College of Animal Sciences , South China Agric. Univ. , Guangzhou 510642 , China) Abstract: The human ubiquitin C-terrnina1 hydro1ase Ll ( UCH_Ll) gene cDNA was used to search the dbEST database for homo1ogous porcine expressed sequence tags (ESTs). A matching EST (BM194679) previous found to express Xiang pig 10ngissimus dorsi muscle was identified. Through in silico cloning and RT-PCR with total RNA from Landrace pig longissimus dorsi muscle as the template , a 1 105 bp cDNA fragment was amp1ified and subsequently sequenced. Sequence ana1ysis revea1ed that this 1 105 bp frag- ment contained