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第二章 蛋白质的结构与功能 2.1 概述 蛋白质的生物学意义 蛋白质作为生命现象的物质基础之一,构成一切细胞和组织结构的最重要的组成成分,参与生物体内许多方面的重要功能。 蛋白质的重要作用 (一)酶的催化作用 (二)转运和贮存功能 (三)运动功能 (四)结构支持作用 (五)免疫作用 (六)生物膜功能 蛋白质的元素组成 蛋白质的分类 1.根据蛋白质的化学组成 2.根据蛋白质的溶解性和组成 3.根据蛋白质分子形状 4.根据蛋白质生物功能 2.2 蛋白质的基本组成单位 2.2.1氨基酸的结构与分类 ---蛋白质的基本结构单位。 非编码氨基酸 属于氨基酸的衍生物,也称为修饰氨基酸。 如:胱氨酸、羟赖氨酸、羟脯氨酸、L-甲状腺素等 非编码氨基酸(胱氨酸) 羟脯氨酸与羟赖氨酸 非蛋白质氨基酸 不是蛋白质的组成成分 以游离或结合的形式存在于生物界 大都是常见氨基酸的衍生物 还有些是β-,γ-,δ-, 和D-型氨基酸 一些是代谢中间产物,如瓜氨酸、鸟氨酸; γ-氨基丁酸等 2.2.2氨基酸的理化性质 2.3 肽 肽的基本概念 肽—是由氨基酸构成的聚合物。 氨基酸之间通过一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸氨基脱水缩合形成酰胺键(肽键)连接而成。 肽的命名、书写阅读与分类 由两个氨基酸组成的肽叫二肽,三个称三肽…,20个以内又称为寡肽。20个以上称多肽。 一般的肽都有一个游离的氨基(N端)和一个游离的羧基(C端)。阅读和书写方向是从N端到C端。 多肽化合物的名称,通常按照肽内氨基酸残基的排列顺序,以残基名称(如某某氨酰)从N端依次阅读到C端,并以C端残基全名结束肽的名称。 绝大多数肽为线性结构,少数肽为环状结构。 命名举例 注意: 在开链肽的N端和C端可以有游离的α氨基和α羧基,而有的开链肽的N端或C端的游离的α氨基或α羧基被别的基团结合(如烷基化、酰化等)或N端残基自身环化。 例如促甲状腺素释放激素的N端残基是谷氨酸,此残基易于自身环化成焦谷氨酰基(α氨基与谷氨酸的γ羧基脱水缩和而成)。 谷胱甘肽(GSH) 活性肽---激素类 活性肽---抗生素类 活性肽---在体内的重要作用 生物的生长、发育、细胞分化、大脑活动、肿瘤病变、免疫防御、生殖控制、抗衰老、生物钟规律及分子进化等均涉及到活性肽。生物活性肽是机体内传递信息、调节代谢和协调器官活动的重要化学信使。 蛋白质的二级结构 蛋白质的二级结构是指多肽链的主链本身通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的构象。 它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。(注:二级结构不涉及侧链的构象) 主要有?-螺旋、?-折叠、?-转角、无规卷曲。 左手螺旋与右手螺旋 转角结构 转角结构 β突起 β突起的结构 无规卷曲或自由回转 αα β×β β迂回 肌红蛋白的三级结构 4.5 蛋白质结构与功能的关系 4.6 蛋白质的重要性质、纯化与鉴定 结构域 结构域的定义 是指在二级结构或超二级结构基础上,多肽链进一步卷曲折叠成相对独立、近似球形的组装体,它是三级结构的局部性区域。 类型: α -螺旋域; β -折叠域; α+β域; α /β域;无规则卷曲+β-回折域; 无规则卷曲+ α -螺旋结构域 两个铁原子 蚯蚓血红蛋白中四个?-螺旋组成的结构域 α-螺旋域 免疫球蛋白VL β -折叠结构域 β -折叠域 丙酮酸激酶结构域4 α /β结构域 3-P-甘油醛脱氢酶结构域2 α+β结构域 木瓜蛋白酶结构域1 无规则卷曲+ α -螺旋结构域 木瓜蛋白酶结构域2 无规则卷曲+β-回折结构域 免疫球蛋白 木瓜蛋白酶内的2个结构域 彼此很不相同 弹性蛋白酶的二个结构域 彼此非常相似 蛋白质的三级结构 即多肽链中所有氨基酸残基的空间关系,其具有二级结构、超二级结构或结构域。 定义: 多肽链在二级结构、超二级结构的基础上,主链构象和侧链构象相互作用,进一步盘曲、折叠形成特定的球状分子结构。 蛋白质的四级结构 由两条或两条以上各自独立具有三级结构的多肽链通过次级键相互缔合而成的蛋白质结构。 其中每条多肽链称为亚基。 定义: 通常亚基只有一条多肽链,但有的亚基由两条或多条多肽链组成,这些多肽链间多以二硫键相连亚基单独存在时无生物学活性。 一般来说具有四级结构的蛋白属于寡聚蛋白。 在蛋白质四级结构中,亚基之间的作用力主要包括:氢键、离子键、范德华力和疏水键。即亚基之间主要是通过次级键彼此缔合在一起。 疏水键是最主要的作用力。 维持蛋白质四级结构的主要作用力 (1)血红蛋
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