杜仲甲羟戊酸激酶EuMK基因鉴定及生物信息学分析-经济林研究.PDF

第32 卷 第1 期 经 济 林 研 究 Vol. 32 No.1 2014 年3 月 Nonwood Forest Research Mar. 2014 杜仲甲羟戊酸激酶（EuMK）基因鉴定及 生物信息学分析 1,2 3a,3b 4 乌云塔娜 ，王 淋 ，叶生晶 （1. 中国林业科学研究院 经济林研究开发中心，河南 郑州 450003 ；2. 国家林业局杜仲工程技术研究中心， 河南 郑州 450003 ；3. 中南林业科技大学a. 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室；b. 林学院，湖南 长沙 4 10004 ；4. 国家林业局中南林业调查规划设计院，湖南 长沙 4 10014 ） 摘 要： 甲羟戊酸激酶 （mevalonate kinase，MK ）是萜类化合物生物合成甲羟戊酸 （mevalonate pathway ， MVA ）途径的限速酶之一。为了探明EuMK 对杜仲胶生物合成的调控机制，对EuMK 所编码蛋白质氨基酸序列 的理化性质、跨膜结构域、疏水性/ 亲水性、蛋白质二、三级结构、结构保守域以及基因组内含子和外显子结构 特征等进行了全面的生物信息学分析，结果发现EuMK 蛋白质序列均存在3 个与甲羟戊酸底物结合及催化反应 有关的保守结构域；EuMK 的氨基酸组成中性的疏水性蛋白居多数，属于稳定的疏水性蛋白；无明显的跨膜结构， EuMK 均在膜外；二级结构为混合型结构的蛋白质。EuMK 均含有4 个外显子，3 个内含子； 基因家族启动子顺 式作用元件潜在功能的预测分析发现，含有大量基本顺式作用元件TATAbox ，CAATbox ，还含有光 （AE-box 、 CGT-motif、Box 4 、G-box ）、生长素 （ERE 、ABRE 、TCA-element ）响应等多个顺式调控元件。 关键词：杜仲；甲羟戊酸激酶；反式聚异戊二烯；生物信息学 中图分类号：S603.2 文献标志码：A 文章编号：1003—8981(2014)01—0006—07 Identification and bioinformatics analysis of EuMK gene in Eucommia ulmoides Wuyuntana1,2, WANG Lin3a, 3b , YE Sheng-j ing4 (1. Non-timber Research and Development Center, CAF, Zhengzhou 450003, Henan, China; 2.The Eucommia Engineering Research Center of State Forestry Administration, Zhengzhou 450003, Henan, China; 3. a. The Key Lab of Non-wood Forest Product of Forestry Ministry; b. College of Forestry, Central South University of Forestry Technology, Changsha 4 10004, Hunan, China; 4.