全基因组外显子测序及其应用.pdfVIP

遗姑HEREDITAS(Beijing)2011年8月，33(8)：847—856 ISSN0253-9772 综述 www．chinagene．ca DoI：10．3724／SP．J．1005．2011．00847 全基因组外显子测序及其应用 张鑫，李敏，张学军 安徽医科大学皮肤病研究所，合肥230032 association 摘要：近年来，众多研究小组开展了大量的全基因组关联研究(Genome—widestudies，GWAS)，发现 并鉴定了许多与复杂疾病／性状相关联的遗传变异，为复杂疾病发病机制的研究提供了重要线索。由于GWAS 的结果存在假阳性、假阴性、检测到的单核苷酸多态性很少位于功能区以及对稀有变异和结构变异不敏感等问 题，导致了其应用的局限性。而新一代测序技术的进步，促进了全基因组测序和全基因组外显子测序的快速发 展，为解决上述问题提供了契机。全基因组外显子测序是利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉 并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。由于其具有对常见和罕见变异高灵敏度，能发现外显子区绝大部 分疾病相关变异以及仅需要对约1％的基因组进行测序等优点，促使全基因组外显子测序成为鉴定孟德尔疾病 的致病基因最有效的策略。也被运用于复杂疾病易感基因的研究和临床诊断中。 关键词：外显子测序；孟德尔疾病；复杂疾病；临床诊断 1一 ● ’● l- - Exome andits sequencln2Anoitacilppa ZHANG Xue—Jun Xin，LIMin，ZHANG Institute Medical 230032，China ofDermatologyofAnhui University，Hefei Abstract：Inrecent haveidentifieda numberof diseases／traits—associatedvari- years．researchers large complex genetic on ants association clues the byperforminggenome—wide studies(GWAS)，whichmayprovideimportant understanding mechanismsofrelated hasitsownlimitationsintermsof false diseases．However,GWAS beingpositive，falsenegative in fewSNPslocatedinthefunctionalareasandinsensitivetodetectrareandstructural results results，very variations，which the limitationofthismethod．Withthe ofthe next-generationsequencingtechnology,wholege— application development all for