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超声波破碎细胞的常见问题
大肠杆菌表达外源蛋白,在超声破碎的时候,用含有1%triton-X-100 的PBS 悬浮,然后超声的
效果较好,1%triton-X-100 的作用还是很明显的,对其他的一些细菌同样起作用,比如链霉菌。
细菌沉淀直接加样品1buffer,再加5ul 的巯基乙醇,混匀,离心,煮沸10min,直接上样,染
色脱色步骤如下:将胶放入适量的染色液微波炉里加热 1min(下次适当补点醋酸即可),将染色液换
成大量的水( 自来水即可)在微波炉煮10min 就可以。
在表达重组蛋白后超声波破碎细胞,采用冰浴,400w ,破2s 停1s,但是不一会就产生大量泡
沫,影响了破碎功率,pbs 和tris 缓冲液都是这样,最后都是破碎不完全,而我的目的蛋白就在
这些未破碎的细胞中。
1*会产生气泡是因为你的探头位置没放好。探头一定要接近底部,约 1cm (我一般是距底部
0.5mm )。功率根据仪器不同会有所不同,但你可以观察液面,有波动但不要太剧烈就好。
2*破3S 停10S,破个二三十次看看。
3*变幅杆位置摆放也要注意,听声音如果不对的话就要及时调整。另外可以从菌浓度方面考虑。
在破碎时试着加大体积,强度最好不要超过60%.
4*尝试超8s 停8s,对有些菌体蛋白来说,你的方法很难散热,导致蛋白变性产生气泡,最好停顿
时间稍长一些,这种情况多见于包涵体形式的蛋白。
问:链霉菌(放线菌)超声破碎的,用的方法条件是什么?
答:前处理一般就是配置成一定浓度的菌悬液。
使用超声破碎时采用的具体条件是:
(1)取细菌的24 h 培养液于5 000 r /min 下离心5 min 收集菌体.
(2)用pH 7 .5 的Na2HPO -NaH2PO 缓冲液洗涤3 次,再用该缓冲液将菌体配成1:3 的菌悬液.置
于40
mL 大塑料试管内.
(3)将大塑料试管置于冰浴中,采用超声波破碎(功率200 W ,1 /2”探头,破碎30 s,间歇30 S) .
(4)破碎液于12 000 r /min 下高速冷冻离心30 min,收集细胞碎片和上清夜.
超声破菌流程与 上述基本一致,就是洗涤菌体也可以用预冷的生理盐水或pH8 的Tris -HCl,
洗涤一次就可以。另外,超声剂量随样品量、菌体改变比较大,功率可以到400 -600w,超5s,
停5s,冰浴,要加终浓度1 mM 的PMSF 。为确定合适的超声强度和次数,有必要随时镜检观察
菌体是否完全破碎。
放线菌属于原核生物系统进化树上的(G +C )摩尔百分含量(mol %)高的革兰氏阳性菌
(Eubacteria )分枝类群,它虽然具有原核生物特有的分子生物学特性,但在其不同类群中,细
胞壁的化学组分变化很大。
在做大肠杆菌超声时,采用的是400W ,超5 停5 的方法,效果不错,但是用在链霉菌上,似
乎没什么效果。会不会就是由于细胞壁组成差异造成的呢,因为大肠杆菌式属于革兰氏阴性菌的。
问:再有镜检是检验破碎效果,但是细胞破碎程度和我需要的酶获得之间有正比关系吗?破碎时
间长也会影响到酶的活性。所以想问问anaisai 战友,你提供的“功率200 W ,1 /2”探头,破碎
30 s,间歇30 S”的条件好像是用于破碎链霉菌孢子的,也可以用于发酵离心后的菌泥吗?如果
可以,你破碎的全程时间大概是多少呢?
答:如果你需要的是胞内酶,细胞破碎程度和需要的酶获得之间基本上有正比关系。破碎时间长
的确会影响到酶的活性。这就需要在最佳的破碎时间和酶活性之间做出判断,最直接的办法是先
绘制相关曲线(酶活性和时间的关系曲线)。
实验中,破碎的是棒状杆菌(也是很难破壁的G+菌),破碎时间控制在30min 左右,酶活较
好。
如果是基质菌丝的话,好可以考虑用溶菌酶处理一下.
一般来讲这几种方法读可以的:
一,液氮研磨
二,用french press 破碎
三,超声波破碎
四,溶菌酶处理预处理
超声波是物质介质中的一种弹性机械波,它既是一种波动形式,又是一种能量形式。超声对细
胞的作用主要有热效应,空化效应和机械效应。热效应是当超声在介质中传播时,摩擦力阻碍了
由超声引起的分子震动,使部分能量转化为局部高热(42 -43 ℃)。空化效应是在超声照射下,
生物体内形成空泡,随着空泡震动和其猛烈的聚爆而产生出机械剪切压力和动荡。另外,空化泡
破裂时产生瞬时高温(约5000℃)、高压(可达500×104Pa ),可使水蒸气热解离产生.OH 自由
基和.H 原子,由.OH 自由基和.H 原子引起的氧
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