元计算系统使用基础-中国科学院超级计算中心.PDFVIP

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“元”计算系统 使用基础 邓笋根 中科院超级计算中心 2015年1月 主要内容 一、 “元”系统介绍 二、用户基本操作和常用命令 三、提交和运行作业 主要内容 一、 “元”系统介绍 二、用户基本操作和常用命令 三、提交和运行作业 “元”超级计算系统 中科院超级计算中心新一代超级 计算系统 含义:通过高效的高性能计算支 撑平台、并行优化及可视化服务, 与广大的高性能计算用户一起开 创高性能计算应用的新纪元  2013年12月9日开标:曙光公司  混合架构,异构计算系统  总计算峰值2.36 Pflops,Linpack性能1.4 Pflops (预计)  系统内存总量140 TB 存储总容量6.3PB,可用容量5 PB,聚合I/O带宽124GB/s  分两期建设(2014、2015 ) 总体结构 一期:总峰值303.4Tflops (CPU 152.32 ,协处理器 151.08 );存储裸容量 2.912PB ,可用2.334PB ,聚 合带宽56.5GB/s 二期总峰值2.056Pflops (CPU 550.45Tflops ,协处理 器1.506Pflops );存储裸容 量3.427PB ,可用2.746PB , 聚合带宽68GB/s 两期统一管理,独立使用。 统一的管理网络,两期IB 网 络互连。 计算:CPU和协处理器 一期  Intel IvyBridge Xeon E5-2680v2 10core@2.8GHz , 单CPU 224Gflops(DP)  Intel Xeon Phi 5110P( 1Tflops), 80块  NVIDIA Tesla K20(1.2Tflops), 60块 二期  Intel下一代Hawell架构Xeon E5-2600v3处理器2.6GHz , 支持AVX2指令集,单CPU约0.5Tflops(DP)  Intel下一代Knights Landing MIC卡,单卡3Tflops(DP)  NVIDIA 下一代Maxwell GPU卡,单卡3Tflops(DP)  1套UV 2000大内存节点,32颗Intel Xeon八核处理器,4TB内存,5.32 Tflops  1套龙芯异构计算资源,≥32颗龙芯3B八核处理器  1套申威异构计算资源,≥32颗申威1600/1610处理器  12台可视化节点 Infiniband网络  一期FDR(56Gbps) 、

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