基于特征挖掘与SVM集成的基因组缺失变异检测-软件工程专业论文.docxVIP

北京化工大学硕士学位论文始集，达到最大化检测敏感度的目的；另一方面，将检测工具与SVM相集成。首先，基于缺失变异的特征研究工作，分别对初始集中的每一个缺失变异从比对信息数据中提取特征，然后利用SVM根据所提取的特征对初始集中的缺失变异进行“真假”判别，剔除假阳性的变异，得到集成检测的最终结果。实验结果表明，该方法比单个工具在检测精度和敏感度上更有优势；相比于多个检测工具结果的简单组合，该方法能在只损失少量检测敏感度的基础上，大幅提高检测精度。关键词：缺失变异，真实测序数据，特征挖掘，SVM，集成检测II万方数据ABSTRACTCALLINGGENoMICDELETIoNSBASEDoNTHEINTEGRATIoNOFFE√气TUREMININGANDSVMABSTRACTWiththeapplicationanddevelopmentofnextgenerationsequencingtechnology,methodsofcallinggenomedeletionsbasedonsequencinghaveproliferated．Duetothelimitationsofnextgenerationsequencing，suchastheshortreadlengthandhighsequencingerrorandotherfactors，usingasinglemethod