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- 2019-04-01 发布于中国
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鲍曼不动杆菌检测分析手册
一、 分类和基因组特征
鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)属于莫拉氏菌科(Moraxellaceae),不动杆菌属,不动杆菌属命名于1986年,基于DNA-DNA杂交试验,已有21个基因种(genomospecies)被确定 (4,32) ,其中只有7种有正式的命名。鲍曼不动杆菌属于基因种2,是不动杆菌属中临床最常见的一种。
目前为止完成全基因组测序的鲍曼不动杆菌共有3株,多重耐药株AYE、全敏感株SDF、ATCC17978 (10,31) ,其基因组信息见表1-1。多重耐药株AYE携带3个质粒,但是令人惊讶的是这3个质粒没有携带任何已知的耐药相关基因。在AYE染色体中共有52个基因被预测与抗性相关(其中只有7个在SDF中也有分布),其中有45个抗性基因紧密地集合在一个86kb的抗性岛中,是目前发现的最大的抗性岛 (10) 。该抗性岛打断了一个“putative ATPase”读码框,该插入位点在SDF也发现伴有插入(19.6kb—25ORFs),都伴随着“ACCGC”的同向重复。目前为止AYE和SDF的基因组序列还没有在网上公布,关于这两个基因组的其他信息还有待进一步公布。
表1-1 测序株基因组信息
菌株号
基因组大小
G+C含量
携带质粒大小
基因组岛
AYE
SDF
ATCC17978
3.9Mb
3.2Mb
3
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