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AGRICULTURE
OFSOUTHERN 2013，44(7)：1069—1075
南方农业学报JOURNAL http：黼·nfnyxb·cn
2095—1191：CODENNNXAAB
ISSN
一一————————————————————————————————————————————————————————————————————一
DOI：10．3969／j：issn．2095-1191．2013．7．1069
factor(ARF)基因的
参薯ADP—ribosylation
生物信息学分析
高洪昌，黄小龙，陈银华，许 云，吴文嫱，谢 俊，黄东益+
(海南大学农学院，海口570228)
摘要：【目的】对参薯等11种植物的ARF基因进行生物信息学分析，为深入研究植物ARF基因的结构与功能分析
奠定基础。【方法】对参薯ARF同源序列进行克隆和序列测定，利用生物信息学相关软件对参薯等11种植物的ARF的
核苷酸序列、氨基酸序列、组成成分、疏水性／亲水性、蛋白质二级和三级结构、信号肽、跨膜结构、导肽进行分析。【结
果】参薯ARF基因同源片段大小为1200bp。系统进化分析结果表明，参薯等11种植物的ARF氨基酸序列可分为I和
II两大类，细分A、B、C、D、E5个亚族，其中参薯ARFl和蒺藜苜蓿组成一个亚族，参薯Am：2和风信子组成一个亚族。
Switch2。参薯ARF蛋白结构以无规则卷曲为主，三级空间结构不稳定。ARF蛋白为疏水性、脂溶性蛋白，无信号肽，存
在明显跨膜结构域；ARF导肽无明确定位，预测等级为3级。【结论】参薯ARF蛋白结构的特殊性为其执行物质转运和
参与信号转导功能奠定基础。
关键词：参薯；ARF基因；生物信息学；聚类分析；蛋白结构
中图分类号：$567．239 文献标志码：A
Bioinformaticsof
ADP—ribosylation
analysis
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Irom仂osCor幽aJa翰L．
GAO Yin-hua，XUYun，WU
Hong-chang，HUANGXiao-long，CHEN Wen—qiang，
XIE
Jun，HUANG
Dong-yi+
of
(CollegeAgronomy，HainanUniversity，Haikou，570228，China)
bioinformatics11 to
of DioseoreaalataL．wasconducted
Abstract：【Objective】Theanalysisplantsincluding provide
for
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