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南方农业学报 Journal of Southern Agriculture 2017 ，48 （4 ）：574-580
ISSN 2095-1191 ； CODEN NNXAAB 南 方 农 业 学 报 http ：//48 卷
DOI ：10.3969/j.issn.2095-1191.2017.04.002
甘蔗钙依赖蛋白激酶基因克隆与序列分析
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曹辉庆 ， 蒋胜理 ， 黄诚梅 ， 邓智年 ， 吴凯朝 ， 徐 林 ，
1 3 3 1 *
陆 珍 ， 陈丽君 ， 李秋凤 ， 魏源文
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（广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室 ， 南宁 530007 ； 广西农业科学院 甘蔗研究所/农业部广西甘蔗生物技术
与遗传改良重点实验室 ， 南宁 530007 ； 3 贺州学院， 广西 贺州 542899）
摘要：【目的】克隆甘蔗钙依赖蛋白激酶基因（ScCDPK 1），为其功能解析和育种利用打下基础。 【方法】根据甘蔗
cDNA文库中的CDPK基因序列信息设计引物，利用RT-PCR克隆ScCDPK 1基因，并采用在线生物信息学分析软件对
其推导蛋白的理化性质、跨膜结构、信号肽及保守结构域等进行预测分析 。【结果】克隆获得的ScCDPK 1基因完整编码
区大小1650 bp，编码549个氨基酸，相对分子量61.971 kD ，等电点（pI ）6.78 ，不稳定指数35.63。 同源性和遗传进化树分
析结果显示，ScCDPK 1基因与小麦TaCPK7基因亲缘关系最近，同源性达88% ；ScCDPK1蛋白与其他已知CDPK蛋白一
致，具有CDPKs家族特有的4个保守区域（可变区、蛋白激酶区、自抑制区和钙离子结合 区），其二级结构主要由α螺旋
（
42.80% ）和无规则卷曲（32.97% ）构成；蛋白功能分类预测结果显示，ScCDPK1蛋白是一种阳离子通道蛋白，可能参与
植物胁迫应答、信号转导和翻译调控等生物反应 。 【结论】ScCDPK 1基因编码的蛋白与其他已知CDPK蛋白一致，具有
CDPKs家族特有的4个保守区域，是一种阳离子通道蛋白。
关键词： 甘蔗； 钙依赖蛋白激酶基因（CDPK ）； 克隆； 序列分析； 生物信息学预测
中图分类号： S566.1 文献标志码：A 文章编号：2095-1191（2017 ）04-0574-07
Cloning and sequence analysis of calcium-dependent
protein kinase gene in sugarcane
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CAO Hui-qing
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