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工 大数据时代工业酶的发掘、改造和利用 1 1 1 2 2 1 郁惠蕾　张志钧　李春秀　钱小龙　郭　飞　许建和 （1　华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室，上海　200237； 2　华东理工大学常熟研究院，苏州百福安酶制剂有限公司，江苏　215000） doi:10.3969/j.issn.1674-0319.2016.02.006 从当今的生物信息大数据出发，提出有别于传统方法的工业酶挖掘新思 路。在此基础上结合最新研究成果，简要介绍几种典型工业酶的设计和改造 新策略。 随着资源、环境问题的日益加剧，可 mining ）就是根据催化特定反应的需要， 持续发展已成为全社会的共同目标。当今 从文献中寻找相关酶的同源基因序列， 作者简介 社会对“可持续发展”、“绿色化学”以 并以此作为基因探针，在基因组数据库 许建和，本科毕业于清华大学化 及“环境友好制造”的呼声越来越高。以 中进行序列比对，筛选获得同源酶的编 学系，华东理工大学与京都大学联合培 养博士。1995年起历任华东理工大学助 节能、降耗、减排和高效生产为目标，基 码信息，继而进行酶的批量异源表达和 研、副研、教授。任教育部长江学者特 于工业酶催化剂的绿色制造过程也越来越 高通量筛选，最终获得催化性能更优的 聘教授, 生物反应器工程国家重点实验 室主任，兼上海生物制造协同创新中心 多地受到学术界和产业界的关注。微生物 新型生物催化剂（1.0版）。随着结构生 主任。亚洲生物技术联合会执委，第一 基因组学、分子与结构生物学、生物信息 物学的迅猛发展，人们对蛋白质结构的 届亚洲生物技术大会共同主席。长期从 事生物催化与生物化工研究，曾主持1 学及计算生物学等现代生物技术的迅猛发 认识逐步加深，加上基因组学和蛋白质 项 “973计划”课题、2项 “863计划” 课题和7项国家自然科学基金。公开发 展，为酶的分子设计、高效制备以及生产 组学所提供的大量结构与功能信息，酶 明专利60多项，授权40项，多项技术转 应用提供了科学基础和技术支撑，使得更 的分子改造也从以往的随机突变，逐渐 让企业。 E-mail:jianhexu@ 多工业规模的生物催化合成成为可能。 发展到半理性或理性设计等更精准的方 1 大数据开启了一次重大的时代转 法 ，甚至可以利用计算机从头设计自然 型，正在改变我们的生活和了解世界的 界不存在的酶2 3 。总之，生物催化剂的 方式，同时也成为新发明和新服务的源 设计和制备已经变得越来越简单，从而 泉。在生物技术领域，由于测序技术成 使得各行各业对特定酶的要求也变得更 本的大幅下跌，人们获得基因序列的速 加迫切和可行。 度是10年前无法想象的。如何才能在最 短的时间内，从海量的基因数据资源中 1　酶资源信息库 迅速鉴别并获得工业上有用的目标酶基 因和活性酶蛋白？基因挖掘（genomic 目前已有众多的数据库公布了酶的 48 生物产业技术 2016 02 3 . ( 月).