羟基加成反应对AT碱基对结构和质子转移过程的影响.pdf

物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao) December Acta Phys. ⁃Chim. Sin., 2010, 26(12) ：3329-3336 3329 [Article] 羟基加成反应对A-T 碱基对结构和质子转移过程的影响 史俊友1,2,* 董丽花1,2 刘永军1 1 2 ( 中国科学院西北高原生物研究所, 西宁 810001; 中国科学院研究生院, 北京 100049) 摘要： 应用密度泛函理论在B3LYP/6-31++G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)水平上对羟基化碱基对A-T 的结构进 8OH 6OH 5OH 2OH 行了研究, 经计算共得到8 种稳定的羟基化加成产物, 其能量的相对顺序为 A-TA-T A-T A-T 4OHA-T5OHA-TA-T2OHA-T4OH(数字表示羟基加成进攻的原子在腺嘌呤或胸腺嘧啶中的编号), 这与其加成反应 前后结构变化的大小密切相关. 当羟基对腺嘌呤端进行加成时, A-T 间的相互作用能略有增加, 而当羟基对胸 8OH 6OH 腺嘧啶进行加成时, A-T 之间的相互作用能略有减小. 另外, 还以能量较低的加成产物 A-T 和A-T 为例对羟 基化碱基对中A 和T 之间的质子转移过程进行了研究, 结果表明羟基化产物中A 与T 之间的质子转移机理由未 加成前的分步双质子转移变为协同双质子转移, 且其势垒低于未加成的A-T 发生第一步(决速步骤)质子转移的 势垒. 关键词： 密度泛函理论; 碱基对; 羟基化; 质子转移; 单电子占据轨道 中图分类号： O641 Effect of Hydroxylation on Structures and Proton Transfer of A-T Base Pairs SHI Jun-You1,2,* DONG Li-Hua1,2 LIU Yong-Jun1 1 ( Northwest Institute of Plateau Biology, Chinese Academy of Sciences, Xining 810001, P. R. China; 2 Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, P. R. China) Abstract ： The structures