牛樟芝中一个新型还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析.pdfVIP

牛樟芝中一个新型还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析.pdf

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-   Guihaia - http:/ / www.guihaia journal.com   Spet.2018ꎬ38(9):1146 1154 DOI:10.11931/ guihaia.gxzw201708037 - 引文格式:原晓龙ꎬ华梅ꎬ陈剑ꎬ等.牛樟芝中一个新型还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析 [J].广西植物ꎬ2018ꎬ38(9):1146 1154 YUANXLꎬHUA MꎬCHENJꎬet al. Cloning and expression analysis of a new reducing polyketide synthase gene inAntrodia camphorata [J]. - Guihaiaꎬ2018ꎬ38(9):1146 1154 牛樟芝中一个新型还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析 原晓龙ꎬ华  梅ꎬ 陈  剑ꎬ王  娟ꎬ杨宇明ꎬ王  毅∗ ( 云南省林业科学院ꎬ云南省森林植物培育与开发利用重点实验室ꎬ国家林业局 云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室ꎬ昆明650204 ) 摘  要:为了研究牛樟芝中PKS基因与化合物之间的关系ꎬ该研究通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮 合酶基因ꎬ以此序列为模板设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝cDNA为模板克隆获得 一个高度还原型PKS(HR ̄PKS)基因全长ꎬ命名为AcPKS2ꎻ对AcPKS2基因进行生物信息学分析ꎬ并比较该基 因在不同培养基上的表达量ꎮ 结果表明:AcPKS2全长7 842 bpꎬ有24个内含子ꎬ其外显子共编码2 613个氨基 酸ꎬ该蛋白的相对分子质量为293.5kDa ꎬ理论等电点pI为5.78ꎮ 用CDD分析其结构域显示ꎬ该基因属于HR ̄ PKSꎬ其结构域组织排列为 KS ̄AT ̄DH ̄MT ̄ER ̄KR ̄ACP ̄TEꎬ8 个结构域其活性位点分别为 β ̄酮基合成酶 (DTACSSSL)、酰基转移酶(GHSIGETA)、脱水酶(RNDGSTSPL)、甲基转移酶(SFDIITAFDV)、烯酰还原酶 (HAGVSSPAA)、酮基还原酶(GSPGQANYTAA)、酰基转移酶(YGLDSLTSVRL)、硫酯酶(KQPNGPY)ꎮ 系统发 育树显示AcPKS2与其他化合物未知的HR ̄PKS蛋白聚为一支ꎬ结构域和系统进化树分析显示该基因可能编 码一种新的含TE结构域高度还原型聚酮合酶ꎻ表达分析结果显示葡萄糖和果糖能够诱导该基因的表达ꎮ 关键词:牛樟芝ꎬ高度还原型PKSꎬ生物信息学分析ꎬ基因表达 中图分类号:Q939.92    文献标识码:A    文章编号:1000 ̄3142(2018)09 ̄1146 ̄09 Cloning and expression analysis of a new reducing polyketide synthase gene inAntrodia camphorata YUANXiaolongꎬHUA MeiꎬCHENJianꎬWANGJuanꎬYang YumingꎬWang Yi∗ ( YunnanProvincialKey Laboratory of Cultivation andExploition of Forest PlantsꎬKey Laboratoryfor Conservation of RareꎬEndanger & Endemic Forest PlantsꎬState ForestryAdministrationꎬYunnanAcademy of ForestryꎬKunming 650204ꎬChina ) Abstract:We isolat

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