计算化学9-常用计算化学应用软件及资源.pptVIP

化学数据库（Data base） 分子结构库 晶体库 热力学数据库 药物库 高分子库 分子光谱、波谱图谱库 生物数据库（蛋白质、核酸、多糖库） 化学文献库 化学人工智能（需借助数据库） 计算机辅助分子结构解释 化学模式识别 结构－活性关系分析 结构－性质关系分析 神经网络算法与神经网络计算机 * * 常用计算化学应用软件及资源 Gaussian 软件 Gaussian的功能很强大 可以做从头算 半经验 DFT Gaussian 软件 可用来研究分子的能量与几何结构 化学反应过渡态的能量与几何结构 振动频率分析、红外与拉曼光谱; 分子的热化学性质、键能 化学反应能 化学反应途径 研究分子轨道的能量与性质 原子电荷分布（布居分析）和自旋密度分布 分子的多极矩（永久偶极矩和四极至十六极矩） NMR 屏蔽常数、化学位移及分子的磁化率、振动园二色强度 电子亲和性与电离势、极化率与超极化率、静电势与电子密度分布等 第一步工作准备输入文件。Gaussian程序对输入文件有一定的格式要求，如图显示了一个完整的Gaussian输入文件 准备好输入文件后，便可在Gaussian程序中读入此输入文件进行计算 程序运算完后，Gaussian会给出正常结束的信息。此时，可打开文本格式的输出文件，提取所需信息。 MOPAC 软件 MOPAC 软件是一款大众化、功能强大的半经验量化程序 可以计算分子、自由基、离子和聚合物的电子结构、光谱，热化学性质、同位素取代效应和力常数等。其中的一个过渡态定位程序和两个过渡态优化程序用于研究化学反应。 此外，它还常用作定量结构－性质（或活性）关系研究中结构参数的计算。 ADF软件 ADF可以进行单点计算、几何优化、寻找过渡态、计算力常数和热化学性质、跟踪反应路径、研究电子结构、通过比较离子的激发态和基态而获得激发能。 新版本的ADF包括了含时密度泛函理论，基组库中包含了1～118号所有元素，而且对常见元素有不同大小的基组，从最小的到高质量的。 ADF软件在材料科学和生命科学均有应用，但更侧重于前者，尤其在重元素化学、无机化学、催化领域非常流行。最新版的ADF加入了QM/MM方法，可用于生物大分子体系的研究。 量子化学资源 International Journal of Quantum chemistry Journal of molecular modeling Journal of physical chemistry Journal of chemical theory and computation （美国化学会2005年推出） Journal of molecular structure (Theochem) Reviews in Computational Chemistry （丛书） Journal of theoretical and computational chemistry Theoretical chemical accounts Journal of computational chemistry Gaussian公司的官方网站 国际上著名的计算化学列表网站，开通较早，内有大量关于计算化学的邮件列表。 北京大学化学系开设的量化计算论坛 厦门大学化学系开设的量化计算论坛 国内著名的量子化学论坛 国内著名的量子化学论坛