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ATAC-seq数据标准分析结题报告.PDF
上海嘉因生物科技有限公司
ATAC-seq 数据标准分析结题报告
项目编号：
项目名称：
项目日期：
上海嘉因生物科技有限公司 监制
Tel: 021 Email: marketing@
上海嘉因生物科技有限公司
目录
一、背景介绍 4
二、实验测序流程 6
1 实验步骤 7
2 上机测序 8
三、生物信息分析流程 9
四、结果展示及说明 10
1 原始序列数据 10
2 测序数据质量评估 10
2.1 测序错误率分布检查 10
2.2 碱基含量分布检查 12
2.3 ADAPTER CONTENT 分析 12
2.4 测序数据过滤 13
3 ATAC-SEQ 数据分析结果展示 14
3.1 项目小结 14
3.2 主要结果展示 15
3.3 ATAC-SEQ 数据标准分析结果详解 16
3.3.1 ATAC-SEQ 数据参考序列比对(READS MAPPING)结果统计 16
3.3.2 结合位点检测(PEAK CALLING)质量控制 18
3.3.3 PEAKS 在全基因组功能性区域上的分布注释 18
3.3.4 回帖序列(MAPPED READS)在基因附近的分布特征分析 20
3.3.5 ATAC-SEQ READS 在基因上的分布HEATMAP 21
3.3.6 结合位点(PEAK)进化保守性分析
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