北京大学理论生物中心招生介绍.DOC

北京大学理论生物学中心招生介绍 一、专业介绍 21世纪是生命科学的时代，也是信息时代。随着人类基因组计划的各项任务接近完成，有关核酸、蛋白质的序列和结构数据呈指数增长。面对巨大而复杂的数据，运用计算机管理数据、控制误差、加速分析过程势在必行, 从而使生物信息学成为当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，也是21世纪自然科学的核心领域之一。近年来，计算机和互联网的发展更是为生物信息的传递提供了硬件基础和便利,大大地推动了生物信息学的发展。生物信息技术的重要性也越来越突出。美国能源部在2001年4月紧接着人类基因组计划提出的旨在了解生命的奥秘的新的“从基因组到生命”的十年宏伟规划的前言中郑重指出：“二十一世纪的生物学最重要的任务是在基因组水平上认识生命的奥秘。毫无疑义，这个目标的达致将依赖于建立在系统生物学和生物信息学相结合基础之上的新一轮的生物信息技术革命”，并进一步提出：“从基因组到生命（GENOME to LIFE） 计划的中心目标是在今后十年里完成国家的相应基础设施建设，以实现不断产出的海量生物学数据和生物学知识同以生物信息学为基础的新生物学的整合”。 生物信息学是生命科学、信息科学、数理科学等众多相关学科相互交融所形成的一门新兴交叉学科。它以核酸、蛋白质等生物大分子为主要研究对象，以数理化等自然科学和信息科学、计算机科学等工程科学为主要手段，以计算机硬件、软件和计算机网络为主要工具，对生物大分子数据进行存储、管理、注释、加工，使之成为具有明确意义的生物信息。并通过对序列和结构数据及其相关文献的查询、搜索、比较、分析，从中获取基因编码、基因调控、代谢途径、核酸和蛋白质结构功能及其相互关系等理性知识。在大量信息和知识的基础上，探索生命起源、生物进化以及细胞、器官和个体的发生、发育、病变、衰亡等生命科学中重大问题，搞清它们的基本规律和时空联系。 近十年来，物理学，统计数学，物理化学、技术科学等学科对生命科学，特别是分子生物学的研究起到了决定性的作用。在某些方面，如基因研究，蛋白质折叠研究等成了学科发展的决定力量，这种现象在科学史上是比较罕见的。生命科学正在迅速由定性研究的科学变为定量研究的科学，这种趋势在今后二十年间会变得更加突出。北京大学理论生物学中心的主要工作是在掌握大量生物信息的基础上，对不同的空间尺度与时间尺度的生命现象做出科学的理论解释。在各个层次上建立理论模型，其中包括建立基因序列的统计模型以预测未知基因与基因调控位点；建立蛋白质折叠的热力学与动力学模型以预测蛋白质的空间结构；建立基因与蛋白质网络的动力学模型以解释生命系统的特殊动力学性质；建立生物进化动力学模型以了解生命进化的过程等。研究的目的是找出生物系统中带有普适性的规律，使得生命科学向定量化方向发展。 二、导师简介 汤超，北京大学物理学院长江讲座教授，北京大学理论生物学中心主任，美国普林斯顿NEC研究所资深研究员，美国物理学会Fellow。毕业于中国科技大学物理系，并获得芝加哥大学博士学位，曾在Brookhaven国家重点实验室和The Institute for Theoretical Physics进行博士后研究工作。 联系方式：010－6279647 Fax：010Email: ctb@ WWW: /homepages/tang/ 研究方向：生物物理、统计物理 蛋白质折叠机理以及应用机理进行新的蛋白质折叠。 蛋白质—DNA相互作用。 生物网络网络动力学。 1987年提出自组织临界现象的概念及理论，开创了一个新领域，其相关论文 (Phys. Rev. Lett. (1987)) 被引用三千多次； 1995年开始从事生物物理方面的研究工作。1996年提出蛋白质结构可设计性概念 (Science (1996))，1998年提出相应的理论 (Proc. Natl. Acad. Sci. (1998))，为用物理思想与方法定量研究生物问题提供了一个范例。1996年在美国科学杂志发表时同期配发了评论性文章，引起相关领域同行的高度关注。 近期发表的代表性论文： J. Zhang, R. Chen, C. Tang, and J. Liang, Origin of scaling behavior of protein packing density: a sequential Monte Carlo study of compact long chain polymers, J. Chem. Phys. 118, 6102 (2003). M. Yahyanejad, M. Kardar, and C. Tang, Structure space of model proteins: a principle component ana